RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 OR2T2Q6IF00 324 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 PGM2L1Q6PCE3 622 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF786Q8N393 782 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 DHRSXQ8N5I4 330 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa3.94□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 C17orf107Q6ZR85 190 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 MSRB3Q8IXL7 192 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 C17orf47Q8NEP4 570 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 INTS14Q96SY0 518 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 OR52D1Q9H346 318 aa3.93□□□□□ -1.78
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