RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336596.6

EPHA3-201, Transcript of EPH receptor A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EPHA3, Length 5,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3-201ENST00000336596 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 DLX5P56178 289 aa6.7□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 ZXDBP98169 803 aa6.7□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 CDC20Q12834 499 aa6.7□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.7□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.7□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.7□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.7□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.7□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 ISL2Q96A47 359 aa6.7□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.7□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.7□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.7□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.7□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 DNPH1O43598 174 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 APOL3O95236 402 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 TFPTP0C1Z6 253 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 ANKRD34CP0C6C1 535 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 LAP3P28838 519 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 RAB7AP51149 207 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 PFN3P60673 137 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 PROX2Q3B8N5 592 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 SPARTQ8N0X7 666 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 ROBO4Q8WZ75 1007 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 FBXO17Q96EF6 278 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 TNFSF11O14788 317 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 CLEC3BP05452 202 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 GRPP07492 148 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 CHRM2P08172 466 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 OR8U8P0C7N1 319 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 CHRNB1P11230 501 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 ZNF17P17021 662 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 MYF6P23409 242 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 PLA2G7Q13093 441 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 SAXO2Q658L1 398 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 INPP5KQ9BT40 448 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 ETAA1Q9NY74 926 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 TAPBPO15533 448 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 NR4A2P43354 598 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 FXYD4P59646 89 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 BPIFB3P59826 476 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 D2HGDHQ8N465 521 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 CHIAQ9BZP6 476 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 SMPD2O60906 423 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 CSF3P09919 207 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 S100A2P29034 98 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 SHBQ15464 509 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 MED30Q96HR3 178 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 LRRC3BQ96PB8 259 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 RAB22AQ9UL26 194 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.69□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 A0A0B4J203 849 aa6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 ZNF728P0DKX0 622 aa6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 FUT4P22083 530 aa6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 TGM4P49221 684 aa6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 RGS19P49795 217 aa6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 IGFBP7Q16270 282 aa6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 EGLN2Q96KS0 407 aa6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
EPHA3-201ENST00000336596 F10P00742 488 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms