RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 HSPB2A8KAH6 182 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 FGF17O60258 216 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 ABOP16442 354 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 HSPB2Q16082 182 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 LFNGQ8NES3 379 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 GFOD1Q9NXC2 390 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 FITM1A5D6W6 292 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 AIPO00170 330 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 KIR2DS4P43632 304 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 KIR2DS1Q14954 304 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 ELSPBP1Q96BH3 223 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 RBPJQ06330 500 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 BAXQ07812 192 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 YIPF6Q96EC8 236 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 MED30Q96HR3 178 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 PLCH1Q4KWH8 1693 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 AADACP22760 399 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 BSGP35613 385 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 RAB11AP62491 216 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 DPPA2Q7Z7J5 298 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 OR6K3Q8NGY3 331 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 WWTR1Q9GZV5 400 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 CHST11Q9NPF2 352 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 AKR7A3O95154 331 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 FOLR1P15328 257 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 EVX1P49640 407 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 DOC2BQ14184 412 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf91Q3C1V1 193 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 TIGD3Q6B0B8 471 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 OPALINQ96PE5 141 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 HRASLSQ9HDD0 168 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087WV62 115 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 TUSC2O75896 110 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 OR2F2O95006 317 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 CHRNB4P30926 498 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 PPICP45877 212 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 OR2F1Q13607 317 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 TPBGQ13641 420 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 BCORP1Q8N888 145 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 OR1S2Q8NGQ3 325 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A17Q9H1V8 727 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 FKRPQ9H9S5 495 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 ALX3O95076 343 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 CD1EP15812 388 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 DGCR2P98153 550 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 HSF1Q00613 529 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 OR51A4Q8NGJ6 313 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 HIPK2Q9H2X6 1198 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 AKR1C1Q04828 323 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 LTC4SQ16873 150 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R5Q9NYW4 299 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 FZD6O60353 706 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 FCMRO60667 390 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 FOXB2Q5VYV0 432 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-CQ95604 372 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 LAT2Q9GZY6 243 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 SPACA1Q9HBV2 294 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R4Q9NYW5 299 aa19.33■□□□□ 0.69
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT19A8MXV4 375 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 OR1M1Q8NGA1 313 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 TJP1Q07157 1748 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 GNB3P16520 340 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM41BQ5BJD5 291 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM19Q96E16 107 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 MED18Q9BUE0 208 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 NTN4Q9HB63 628 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 SIT1Q9Y3P8 196 aa19.33■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ST8SIA3O43173 380 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 B4GALT3O60512 393 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 SLC2A10O95528 541 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD34AQ69YU3 496 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM178AQ8NBL3 297 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 WBP2Q969T9 261 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 PRRT4C9JH25 899 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ICMTO60725 284 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 RGS11O94810 467 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 CYB561P49447 251 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 EGR3Q06889 387 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ACKR1Q16570 336 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 OR10K2Q6IF99 312 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A11Q9NSA0 550 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 SULT1C4O75897 302 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 SLC2A1P11166 492 aa19.32■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 OR1D5P58170 312 aa19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms