RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 GRM6O15303 877 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 SLC31A2O15432 143 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 MBTPS2O43462 519 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 ADAP1O75689 374 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 STK17BO94768 372 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 OR8U9P0C7N5 309 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 FOSL2P15408 326 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 TSFMP43897 325 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 FLT3LGP49771 235 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 RBP2P50120 134 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF84P51523 738 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 HTRA3P83110 453 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 POMZP3Q6PJE2 187 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 UBE3DQ7Z6J8 389 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 CLEC1AQ8NC01 280 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 OR8U1Q8NH10 309 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 OPA3Q9H6K4 179 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 KCNJ16Q9NPI9 418 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 KPTNQ9Y664 436 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 NDUFB2O95178 105 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 OR2C1O95371 312 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 CD74P04233 296 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 LPCAT3Q6P1A2 487 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD16Q6P6B7 361 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 LYG2Q86SG7 212 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 GVQW1Q8N7I0 195 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 GPR148Q8TDV2 347 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 ALG12Q9BV10 488 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 NRSN2Q9GZP1 204 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 VSIG4Q9Y279 399 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 WIF1Q9Y5W5 379 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 TRPM7Q96QT4 1865 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 CYTIPO60759 359 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 HEXAP06865 529 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 SLC35G4P0C7Q5 338 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 GIMD1P0DJR0 217 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 SLC25A4P12235 298 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 FABP4P15090 132 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 TIMP2P16035 220 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 SPOCK1Q08629 439 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 ELOCQ15369 112 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 NNATQ16517 81 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 GLYATL3Q5SZD4 288 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 AMZ2Q86W34 360 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM104Q8NE00 496 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF417Q8TAU3 575 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 ATG101Q9BSB4 218 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 MRI1Q9BV20 369 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 OR52A5Q9H2C5 316 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 SCN8AQ9UQD0 1980 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 SOX15O60248 233 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 ITGB2P05107 769 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 LAG3P18627 525 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 GABRA3P34903 492 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 SLC35D2Q76EJ3 337 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 DPY19L4Q7Z388 723 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 OR2L13Q8N349 312 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 RAB42Q8N4Z0 105 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 BHLHE23Q8NDY6 225 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 CMBLQ96DG6 245 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 WDR34Q96EX3 536 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1B0GWA3 101 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 GPANK1O95872 356 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 CD8AP01732 235 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 RGS19P49795 217 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 DIO1P49895 249 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 SULT1A1P50225 295 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF136P52737 540 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM25Q86YD3 366 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 OR2L2Q8NH16 312 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 SLC2A12Q8TD20 617 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 CKLFQ9UBR5 152 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1B0GTQ1 180 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 C9orf170A2RU37 121 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF726A6NNF4 738 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 PPP1R2P9O14990 202 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 CRHP06850 196 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 ITGA5P08648 1049 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 CAMLGP49069 296 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 SLC22A6Q4U2R8 563 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF679Q8IYX0 411 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRR-201ENST00000283228 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms