RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261667.7

KPNA3-201, Transcript of karyopherin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KPNA3, Length 4,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3-201ENST00000261667 UPK1AO00322 258 aa9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 MSTNO14793 375 aa9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 MPIG6BO95866 241 aa9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 ADH5P11766 374 aa9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 SRMP19623 302 aa9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 FBLP22087 321 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 HOXC13P31276 330 aa9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 TGIF1Q15583 401 aa9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 PPP1R16AQ96I34 528 aa9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 C1orf123Q9NWV4 160 aa9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 SIRT5Q9NXA8 310 aa9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 FBXO4Q9UKT5 387 aa9.8□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 A6NCN8 305 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 LDB2O43679 373 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 C8orf89P0DMQ9 161 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 CTSSP25774 331 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 SEMG2Q02383 582 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 HERPUD1Q15011 391 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 TAZQ16635 292 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 AMZ1Q400G9 498 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF805Q5CZA5 627 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 CNTN4Q8IWV2 1026 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 GRHPRQ9UBQ7 328 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 ETV7Q9Y603 341 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 CCDC187A0A096LP49 1063 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 CXCL14O95715 111 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 DRD2P14416 443 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 PMCHP20382 165 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 HSD3B2P26439 372 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 NUBP1P53384 320 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 PRRX1P54821 245 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 PCBD2Q9H0N5 130 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 CA10Q9NS85 328 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 LPAR3Q9UBY5 353 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 A0A1W2PQH9 124 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 GLOD5A6NK44 160 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 FAM166BA8MTA8 275 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 RANBP10Q6VN20 620 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 TMPPEQ6ZT21 453 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF695Q8IW36 515 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 NPWQ8N729 165 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 PPTC7Q8NI37 304 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 SDSLQ96GA7 329 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 OR52D1Q9H346 318 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 SLC35D1Q9NTN3 355 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 MED17Q9NVC6 651 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 CD84Q9UIB8 345 aa9.79□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 LANCL1O43813 399 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 OR7C2O60412 319 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 PTHLHP12272 177 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 HTR1FP30939 366 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF684Q5T5D7 378 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 SLC39A11Q8N1S5 342 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.78□□□□□ -0.845e-6■■■■□ 19.3
KPNA3-201ENST00000261667 STARD4Q96DR4 205 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 TSGA13Q96PP4 275 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 IL26Q9NPH9 171 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 ACER3Q9NUN7 267 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 HSF4Q9ULV5 492 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 CBLCQ9ULV8 474 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 UBE2CO00762 179 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 OR5G3P0C626 314 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF620Q6ZNG0 422 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 SLC16A14Q7RTX9 510 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 TMEM104Q8NE00 496 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 VN1R17PQ8TDU5 208 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 PRRC1Q96M27 445 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 SLC12A9Q9BXP2 914 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 MOSPD3O75425 235 aa9.78□□□□□ -0.84
KPNA3-201ENST00000261667 COX5BP10606 129 aa9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms