RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255304.8

USPL1-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USPL1, Length 3,814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1-201ENST00000255304 CCDC36Q8IYA8 594 aa6.94□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 OR4D9Q8NGE8 314 aa6.94□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.94□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 TCTN2Q96GX1 697 aa6.94□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 TEAD3Q99594 435 aa6.94□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 GPA33Q99795 319 aa6.94□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.94□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.94□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.94□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.94□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 ACACBO00763 2458 aa6.94□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 A0A0A6YYD5 115 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 SUSD5O60279 629 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 KNG1P01042 644 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 SFTPBP07988 381 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 SLC35E2P0CK97 266 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 BCKDHBP21953 392 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 GUCA2BQ16661 112 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 ZNF615Q8N8J6 731 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 TCEAL3Q969E4 200 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 TOMM40LQ969M1 308 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 SEC22AQ96IW7 307 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 RHOVQ96L33 236 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 INTS14Q96SY0 518 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 BIN3Q9NQY0 253 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 A0A1W2PQF6 199 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 FITM1A5D6W6 292 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 ZAR1LA6NP61 321 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 IMPA2O14732 288 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 BET1O15155 118 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 CTNSO60931 367 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 AMY2AP04746 511 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 CD27P26842 260 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 LSSP48449 732 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 RAB13P51153 203 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 FZD2Q14332 565 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 LCN10Q6JVE6 187 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 APOOLQ6UXV4 268 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 P4HA3Q7Z4N8 544 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 OR2A5Q96R48 311 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 EMC7Q9NPA0 242 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 ZNF292O60281 2723 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 OR6C68A6NDL8 312 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 TLCD2A6NGC4 264 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 SYT7O43581 403 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 FZD7O75084 574 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 CYB5AP00167 134 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 AK1P00568 194 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 LCATP04180 440 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 ZNF35P13682 527 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 PTAFRP25105 342 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 GZMMP51124 257 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 CA13Q8N1Q1 262 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 BCORP1Q8N888 145 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 EDAQ92838 391 aa6.93□□□□□ -1.3
USPL1-201ENST00000255304 SLC25A28Q96A46 364 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 157.3 ms