RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 YY1P25490 414 aa25.19■■□□□ 1.62
ATG4D-208ENST00000588667 CRBNQ96SW2 442 aa25.19■■□□□ 1.62
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ATG4D-208ENST00000588667 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.19■■□□□ 1.62
ATG4D-208ENST00000588667 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ATG4D-208ENST00000588667 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.18■■□□□ 1.62
ATG4D-208ENST00000588667 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ATG4D-208ENST00000588667 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.17■■□□□ 1.62
ATG4D-208ENST00000588667 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
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ATG4D-208ENST00000588667 GPSM2P81274 684 aa25.16■■□□□ 1.62
ATG4D-208ENST00000588667 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.16■■□□□ 1.62
ATG4D-208ENST00000588667 A0A1B0GUL6 1792 aa25.16■■□□□ 1.62
ATG4D-208ENST00000588667 GNAI2P04899 355 aa25.15■■□□□ 1.62
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ATG4D-208ENST00000588667 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
ATG4D-208ENST00000588667 VPS33BQ9H267 617 aa25.15■■□□□ 1.62
ATG4D-208ENST00000588667 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.15■■□□□ 1.62
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ATG4D-208ENST00000588667 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
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ATG4D-208ENST00000588667 COG6Q9Y2V7 657 aa25.12■■□□□ 1.61
ATG4D-208ENST00000588667 MTX1Q13505 466 aa25.12■■□□□ 1.61
ATG4D-208ENST00000588667 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.12■■□□□ 1.61
ATG4D-208ENST00000588667 POLLQ9UGP5 575 aa25.12■■□□□ 1.61
ATG4D-208ENST00000588667 GGA1Q9UJY5 639 aa25.12■■□□□ 1.61
ATG4D-208ENST00000588667 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.12■■□□□ 1.61
ATG4D-208ENST00000588667 PPIP5K2O43314 1243 aa25.11■■□□□ 1.61
ATG4D-208ENST00000588667 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.11■■□□□ 1.61
ATG4D-208ENST00000588667 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.11■■□□□ 1.61
ATG4D-208ENST00000588667 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.11■■□□□ 1.61
ATG4D-208ENST00000588667 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.11■■□□□ 1.61
ATG4D-208ENST00000588667 COL4A5P29400 1685 aa25.1■■□□□ 1.61
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ATG4D-208ENST00000588667 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
ATG4D-208ENST00000588667 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.1■■□□□ 1.61
ATG4D-208ENST00000588667 AOC3Q16853 763 aa25.1■■□□□ 1.61
ATG4D-208ENST00000588667 ATP2B4P23634 1241 aa25.09■■□□□ 1.61
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ATG4D-208ENST00000588667 EYA3Q99504 573 aa25.09■■□□□ 1.61
ATG4D-208ENST00000588667 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.08■■□□□ 1.61
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ATG4D-208ENST00000588667 WASHC4Q2M389 1173 aa25.08■■□□□ 1.6
ATG4D-208ENST00000588667 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
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ATG4D-208ENST00000588667 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
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ATG4D-208ENST00000588667 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.04■■□□□ 1.6
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ATG4D-208ENST00000588667 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.03■■□□□ 1.6
ATG4D-208ENST00000588667 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.02■■□□□ 1.6
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ATG4D-208ENST00000588667 CEP85Q6P2H3 762 aa25■■□□□ 1.59
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ATG4D-208ENST00000588667 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
ATG4D-208ENST00000588667 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.98■■□□□ 1.59
ATG4D-208ENST00000588667 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
ATG4D-208ENST00000588667 SCN9AQ15858 1988 aa24.98■■□□□ 1.59
ATG4D-208ENST00000588667 WDR90Q96KV7 1748 aa24.98■■□□□ 1.59
ATG4D-208ENST00000588667 SNAP23O00161 211 aa24.97■■□□□ 1.59
ATG4D-208ENST00000588667 ECE2O60344 883 aa24.97■■□□□ 1.59
ATG4D-208ENST00000588667 PDE8BO95263 885 aa24.97■■□□□ 1.59
ATG4D-208ENST00000588667 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
ATG4D-208ENST00000588667 UBE4AQ14139 1066 aa24.97■■□□□ 1.59
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