RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587934.1

GIPC1-208, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, human

TSL 5

Gene GIPC1, Length 330 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIPC1-208	ENST00000587934	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		11.55	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	11.55	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		11.55	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	11.55	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	CAMTA2	O94983	1202 aa		11.54	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	11.54	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	NPR1	P16066	1061 aa		11.54	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	SCNN1D	P51172	638 aa		11.54	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		11.54	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		11.54	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	JDP2	Q8WYK2	163 aa		11.54	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	LNPK	Q9C0E8	428 aa		11.54	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	SNED1	Q8TER0	1413 aa		11.53	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		11.53	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		11.53	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		11.53	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		11.53	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		11.53	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		11.53	□□□□□ -0.56
GIPC1-208	ENST00000587934	ZIC5	Q96T25	663 aa		11.52	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		11.52	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		11.52	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		11.51	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	UQCRH	P07919	91 aa		11.51	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		11.51	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		11.51	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		11.51	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	NUP98	P52948	1817 aa		11.51	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	MBD3	O95983	291 aa		11.5	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	A1BG	P04217	495 aa		11.5	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	IL13	P35225	146 aa		11.5	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		11.5	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	MCTP1	Q6DN14	999 aa		11.5	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	PSMD1	Q99460	953 aa		11.5	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		11.5	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	AK9	Q5TCS8	1911 aa		11.49	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	ALDH1B1	P30837	517 aa		11.49	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		11.49	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		11.49	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	FAM177B	A6PVY3	158 aa		11.48	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	HMOX1	P09601	288 aa		11.48	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	NOG	Q13253	232 aa		11.48	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		11.48	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	RBSN	Q9H1K0	784 aa		11.48	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		11.48	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	ABCC4	O15439	1325 aa		11.48	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	ST18	O60284	1047 aa		11.47	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	ZNF790	Q6PG37	636 aa		11.47	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	CASC1	Q6TDU7	716 aa		11.47	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		11.47	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		11.46	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		11.46	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	SLC51A	Q86UW1	340 aa		11.46	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	NIM1K	Q8IY84	436 aa		11.46	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		11.46	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	11.46	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		11.46	□□□□□ -0.57
GIPC1-208	ENST00000587934	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
GIPC1-208	ENST00000587934	HUNK	P57058	714 aa		11.45	□□□□□ -0.58
GIPC1-208	ENST00000587934	TTC22	Q5TAA0	569 aa		11.45	□□□□□ -0.58
GIPC1-208	ENST00000587934	NBPF15	Q8N660	670 aa		11.45	□□□□□ -0.58
GIPC1-208	ENST00000587934	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		11.45	□□□□□ -0.58
GIPC1-208	ENST00000587934	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		11.45	□□□□□ -0.58
GIPC1-208	ENST00000587934	ABCC12	Q96J65	1359 aa		11.44	□□□□□ -0.58
GIPC1-208	ENST00000587934	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
GIPC1-208	ENST00000587934	TRPA1	O75762	1119 aa		11.44	□□□□□ -0.58
GIPC1-208	ENST00000587934	MCM2	P49736	904 aa		11.44	□□□□□ -0.58
GIPC1-208	ENST00000587934	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		11.44	□□□□□ -0.58
GIPC1-208	ENST00000587934	TEF	Q10587	303 aa		11.44	□□□□□ -0.58
GIPC1-208	ENST00000587934	UVSSA	Q2YD98	709 aa		11.44	□□□□□ -0.58
GIPC1-208	ENST00000587934	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		11.44	□□□□□ -0.58
GIPC1-208	ENST00000587934	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
GIPC1-208	ENST00000587934	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		11.44	□□□□□ -0.58

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