RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF521Q96K83 1311 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 CDHR2Q9BYE9 1310 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 PSME4Q14997 1843 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 H7C1W4 665 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 POTEIP0CG38 1075 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 POTEJP0CG39 1038 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA2012Q0VF49 1180 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 CHADLQ6NUI6 762 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 EYA3Q99504 573 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 BCL2L13Q9BXK5 485 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GUL6 1792 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 PITPNM1O00562 1244 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 RAD17O75943 681 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 HTRA3P83110 453 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 SLFN5Q08AF3 891 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 TNIP1Q15025 636 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 CIAPIN1Q6FI81 312 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 LDHDQ86WU2 507 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 TTLL11Q8NHH1 800 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 CDCA7LQ96GN5 454 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 GREM2Q9H772 168 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 UFL1O94874 794 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 EPS15P42566 896 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 CXCL9Q07325 125 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 DOK7Q18PE1 504 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 BEND3Q5T5X7 828 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 TBC1D16Q8TBP0 767 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 DBNDD1Q9H9R9 158 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 POLLQ9UGP5 575 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 GGA1Q9UJY5 639 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 SCN9AQ15858 1988 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 ITGA6P23229 1130 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 MIER1Q8N108 512 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 TRPM7Q96QT4 1865 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 MPHOSPH8Q99549 860 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 ATP2B4P23634 1241 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 SCNN1DP51172 638 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 CNTROBQ8N137 903 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 SSH1Q8WYL5 1049 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 PLA2G12BQ9BX93 195 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 PODXL2Q9NZ53 605 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 XDHP47989 1333 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRM-214ENST00000583153 YDJCA8MPS7 323 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 H7C1D1 291 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 GRM8O00222 908 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 ECE2O60344 883 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 ALDH1L1O75891 902 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 CSF1RP07333 972 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 CASP7P55210 303 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 FAM161AQ3B820 660 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 KLRG1Q96E93 195 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 SMC4Q9NTJ3 1288 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 GPRC5DQ9NZD1 345 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 MINPP1Q9UNW1 487 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 HAX1O00165 279 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 KCNJ4P48050 445 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC57Q2TAC2 916 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 LMBR1LQ6UX01 489 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD2Q9GZV1 360 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 PTPRCP08575 1304 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 PASKQ96RG2 1323 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 PSMD14O00487 310 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 CCT4P50991 539 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 FOXO4P98177 505 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 ALDH1L2Q3SY69 923 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 KCNQ5Q9NR82 932 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 THSD7BQ9C0I4 1608 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 RTL9Q8NET4 1388 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 ATXN8OSP0DMR3 200 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP10.49□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 MICALL2Q8IY33 904 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 JMYQ8N9B5 988 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 FBXW7Q969H0 707 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 CNNM1Q9NRU3 951 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRM-214ENST00000583153 CREBZFQ9NS37 354 aa10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms