RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPSM2P81274 684 aa41.34■■■■■ 4.21
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf115Q9H7X2 142 aa41.34■■■■■ 4.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa41.33■■■■■ 4.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa41.33■■■■■ 4.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
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CTDNEP1-209ENST00000574205 XDHP47989 1333 aa41.32■■■■■ 4.21
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD2Q9GZV1 360 aa41.28■■■■■ 4.2
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CTDNEP1-209ENST00000574205 VPS33BQ9H267 617 aa41.27■■■■■ 4.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLLQ9UGP5 575 aa41.27■■■■■ 4.2
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TBC1D16Q8TBP0 767 aa41.26■■■■■ 4.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 GGA1Q9UJY5 639 aa41.26■■■■■ 4.2
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP8B2P98198 1209 aa41.24■■■■■ 4.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 COPRSQ9NQ92 184 aa41.24■■■■■ 4.19
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CTDNEP1-209ENST00000574205 UFL1O94874 794 aa41.23■■■■■ 4.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP2B4P23634 1241 aa41.23■■■■■ 4.19
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC24Q50LG9 513 aa41.22■■■■■ 4.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 EYA3Q99504 573 aa41.22■■■■■ 4.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 MROH5Q6ZUA9 1318 aa41.22■■■■■ 4.19
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TIAM2Q8IVF5 1701 aa41.21■■■■■ 4.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPIP5K2O43314 1243 aa41.2■■■■■ 4.19
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CIAO1O76071 339 aa41.19■■■■■ 4.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA2012Q0VF49 1180 aa41.19■■■■■ 4.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLA2Q14181 598 aa41.19■■■■■ 4.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 AOC3Q16853 763 aa41.19■■■■■ 4.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 LARGE2Q8N3Y3 721 aa41.19■■■■■ 4.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 SSH3Q8TE77 659 aa41.19■■■■■ 4.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TAF5LO75529 589 aa41.17■■■■■ 4.18
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CTDNEP1-209ENST00000574205 COL4A5P29400 1685 aa41.14■■■■■ 4.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNJ4P48050 445 aa41.14■■■■■ 4.18
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CTDNEP1-209ENST00000574205 IL15P40933 162 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ECE2O60344 883 aa41■■■■■ 4.15
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DPY19L2Q6NUT2 758 aa41■■■■■ 4.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLTPD2A6NH11 291 aa40.98■■■■■ 4.15
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