RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552896.1

TRAFD1-209, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene TRAFD1, Length 983 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-209ENST00000552896 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAFD1-209ENST00000552896 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAFD1-209ENST00000552896 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAFD1-209ENST00000552896 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAFD1-209ENST00000552896 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAFD1-209ENST00000552896 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAFD1-209ENST00000552896 VPS33BQ9H267 617 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAFD1-209ENST00000552896 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAFD1-209ENST00000552896 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAFD1-209ENST00000552896 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAFD1-209ENST00000552896 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAFD1-209ENST00000552896 XDHP47989 1333 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAFD1-209ENST00000552896 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAFD1-209ENST00000552896 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAFD1-209ENST00000552896 MEIS3Q99687 375 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAFD1-209ENST00000552896 GNAI3P08754 354 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 GPSM2P81274 684 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 PPIP5K2O43314 1243 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 MS4A1P11836 297 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 RLBP1P12271 317 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 UFL1O94874 794 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 AOC3Q16853 763 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 JDP2Q8WYK2 163 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 EYA3Q99504 573 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 POLLQ9UGP5 575 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 GGA1Q9UJY5 639 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 MED23Q9ULK4 1368 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 GLTPD2A6NH11 291 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 FZD9O00144 591 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 ITPRIPQ8IWB1 547 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 NIM1KQ8IY84 436 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 C6orf229H3BNL8 230 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 ATP2B4P23634 1241 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 WASHC4Q2M389 1173 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 CHRNDQ07001 517 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 MTX1Q13505 466 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-209ENST00000552896 GNAI2P04899 355 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 PANK1Q8TE04 598 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 GPC2Q8N158 579 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 ZNF609O15014 1411 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 PLIN1O60240 522 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 PDE3AQ14432 1141 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 FBXO3Q9UK99 471 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 ECE2O60344 883 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 KCNJ4P48050 445 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 YDJCA8MPS7 323 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 KIF3CO14782 793 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 RIMBP2O15034 1052 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 SRGAP3O43295 1099 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 CIAO1O76071 339 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 LRRC24Q50LG9 513 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 EYA2O00167 538 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 TAF5LO75529 589 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 RRP1P56182 461 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TRAFD1-209ENST00000552896 CXCL9Q07325 125 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms