RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 ATG9AQ7Z3C6 839 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 FBXO3Q9UK99 471 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 EYA2O00167 538 aa24.81■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.81■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 CCDC93Q567U6 631 aa24.8■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.79■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 HMMRO75330 724 aa24.79■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 SOGA3Q5TF21 947 aa24.79■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.79■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 SIL1Q9H173 461 aa24.79■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.79■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 UTRNP46939 3433 aa24.79■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 GPSM2P81274 684 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 CHRNDQ07001 517 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 NEFLP07196 543 aa24.77■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ACTB-210ENST00000477812 NFKBIEO00221 500 aa24.76■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.76■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.76■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.75■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 XDHP47989 1333 aa24.75■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 GPR162Q16538 588 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 PSMD1Q99460 953 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 SASH1O94885 1247 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 MPNDQ8N594 471 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 POLLQ9UGP5 575 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 TAF5LO75529 589 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.552e-6■■□□□ 13.5
ACTB-210ENST00000477812 METTL24Q5JXM2 366 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 DCTPP1Q9H773 170 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 PDE8BO95263 885 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.556e-29■□□□□ 11.1
ACTB-210ENST00000477812 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-210ENST00000477812 SNAP23O00161 211 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 GRIN3BO60391 1043 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 IGHDP01880 384 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 ATP2B4P23634 1241 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 PRELPP51888 382 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 RASSF7Q02833 373 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 GGA1Q9UJY5 639 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 UFL1O94874 794 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 FGFR2P21802 821 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 TFCP2Q12800 502 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.68■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 COL4A5P29400 1685 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 KLRK1P26718 216 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 ZNF609O15014 1411 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 MED23Q9ULK4 1368 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 RAB11FIP3O75154 756 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 UBE4AQ14139 1066 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 C6orf229H3BNL8 230 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 SBF1O95248 1867 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 SMC5Q8IY18 1101 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 GPR108Q9NPR9 543 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-210ENST00000477812 KCNJ4P48050 445 aa24.63■■□□□ 1.53
ACTB-210ENST00000477812 ATP2B3Q16720 1220 aa24.63■■□□□ 1.53
ACTB-210ENST00000477812 LPIN2Q92539 896 aa24.63■■□□□ 1.53
ACTB-210ENST00000477812 GCC1Q96CN9 775 aa24.63■■□□□ 1.53
ACTB-210ENST00000477812 VPS33BQ9H267 617 aa24.63■■□□□ 1.53
ACTB-210ENST00000477812 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
ACTB-210ENST00000477812 AOC3Q16853 763 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-210ENST00000477812 TNNI3KQ59H18 835 aa24.62■■□□□ 1.53
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