RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 SUSD3Q96L08 255 aa6.44□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.44□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.44□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 F6X3S4 739 aa6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 EREGO14944 169 aa6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 AMPD3Q01432 767 aa6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 TNNI3KQ59H18 835 aa6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 PLA2G2CQ5R387 149 aa6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 CHRDQ9H2X0 955 aa6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 USP20Q9Y2K6 914 aa6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.43□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 ESYT3A0FGR9 886 aa6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF223E7ERA6 249 aa6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 GREM1O60565 184 aa6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 INPP5BP32019 993 aa6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 PLA2G4AP47712 749 aa6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 GYS2P54840 703 aa6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP3K10Q02779 954 aa6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 NBPF1Q3BBV0 1214 aa6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 GNASQ5JWF2 1037 aa6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 GORABQ5T7V8 394 aa6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 SV2BQ7L1I2 683 aa6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 LILRB2Q8N423 598 aa6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 RHOVQ96L33 236 aa6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJC7Q99615 494 aa6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.41□□□□□ -1.38
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CBX1P4-201ENST00000439415 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
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CBX1P4-201ENST00000439415 Q6ZVU0 165 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 NKD1Q969G9 470 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 AIDAQ96BJ3 306 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 EHD4Q9H223 541 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM260Q9NX78 707 aa6.41□□□□□ -1.38
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CBX1P4-201ENST00000439415 GARTP22102 1010 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 GGCXP38435 758 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 FCGRTP55899 365 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 APOBRQ0VD83 1088 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 PHC3Q8NDX5 983 aa6.4□□□□□ -1.38
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CBX1P4-201ENST00000439415 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 UBP1Q9NZI7 540 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1P4-201ENST00000439415 PDPK1O15530 556 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 PF4P02776 101 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 EPB42P16452 691 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 CES1P23141 567 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 GPC1P35052 558 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 VEGFBP49765 207 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 PTPN5P54829 565 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 LMNB2Q03252 620 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 RASGRF1Q13972 1273 aa6.39□□□□□ -1.39
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CBX1P4-201ENST00000439415 DDR2Q16832 855 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 C4orf17Q53FE4 359 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 IFFO2Q5TF58 517 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 FEZ1Q99689 392 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 CNTN3Q9P232 1028 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PP55 124 aa6.38□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 RGS20O76081 388 aa6.38□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 EDN3P14138 238 aa6.38□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 MASP1P48740 699 aa6.38□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 LIG3P49916 1009 aa6.38□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 GRIN2CQ14957 1233 aa6.38□□□□□ -1.39
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.38□□□□□ -1.39
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