RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 APBB1O00213 710 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 CIAO1O76071 339 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 TTLL6Q8N841 843 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 PIM2Q9P1W9 311 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXA4-202ENST00000428284 GCC1Q96CN9 775 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 TMC4Q7Z404 712 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 RAB11FIP3O75154 756 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 METTL24Q5JXM2 366 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 CHRNDQ07001 517 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
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HOXA4-202ENST00000428284 SMC5Q8IY18 1101 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 SP8Q8IXZ3 490 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXA4-202ENST00000428284 SASH1O94885 1247 aa25.45■■□□□ 1.66
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HOXA4-202ENST00000428284 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 BCL11AQ9H165 835 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.45■■□□□ 1.66
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HOXA4-202ENST00000428284 LTBP1Q14766 1721 aa25.44■■□□□ 1.66
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HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 BCS1LQ9Y276 419 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 C21orf2O43822 256 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 TAF5LO75529 589 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 PDE8BO95263 885 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 XDHP47989 1333 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 GPSM2P81274 684 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
HOXA4-202ENST00000428284 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.4■■□□□ 1.66
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HOXA4-202ENST00000428284 ZNF609O15014 1411 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC93Q567U6 631 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 SOGA3Q5TF21 947 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 MPNDQ8N594 471 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 NUCB1Q02818 461 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 ATP2B3Q16720 1220 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 TNNI3KQ59H18 835 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 LNPKQ9C0E8 428 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 GGA1Q9UJY5 639 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 SNAP23O00161 211 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 UFL1O94874 794 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 AACSQ86V21 672 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 GPR108Q9NPR9 543 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 SNED1Q8TER0 1413 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1B0GUL7 405 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 ATP2B4P23634 1241 aa25.35■■□□□ 1.65
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HOXA4-202ENST00000428284 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 C6orf229H3BNL8 230 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 SLC5A1P13866 664 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 LPIN2Q92539 896 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 FGFR2P21802 821 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXA4-202ENST00000428284 TIMM10P62072 90 aa25.33■■□□□ 1.65
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