RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CHP1-208	ENST00000560965	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CHP1-208	ENST00000560965	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CHP1-208	ENST00000560965	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CHP1-208	ENST00000560965	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CHP1-208	ENST00000560965	LRRC42	Q9Y546	428 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CHP1-208	ENST00000560965	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CHP1-208	ENST00000560965	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CHP1-208	ENST00000560965		U3KQE9	123 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CHP1-208	ENST00000560965	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CHP1-208	ENST00000560965	CHD6	Q8TD26	2715 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	NBAS	A2RRP1	2371 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	TNFSF13	O75888	250 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	PPP1R3D	O95685	299 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	OPN1LW	P04000	364 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	GLI4	P10075	376 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	MPG	P29372	298 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	CHRNB4	P30926	498 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	CAPZA2	P47755	286 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	CSNK1A1	P48729	337 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF84	P51523	738 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	BID	P55957	195 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	ISL1	P61371	349 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	ERVK-25	P63136	954 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	MED21	Q13503	144 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	GGTLC2	Q14390	218 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	C3AR1	Q16581	482 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	MEST	Q5EB52	335 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	KRT80	Q6KB66	452 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	NIPAL3	Q6P499	406 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	XKRX	Q6PP77	449 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	CYGB	Q8WWM9	190 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM54	Q969K7	222 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	KIRREL1	Q96J84	757 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	OR2M2	Q96R28	347 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	MBOAT4	Q96T53	435 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	DDO	Q99489	341 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	NELFA	Q9H3P2	528 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	CLN6	Q9NWW5	311 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	MED29	Q9NX70	200 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	GLTP	Q9NZD2	209 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	JKAMP	Q9P055	326 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	UPB1	Q9UBR1	384 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	PROCR	Q9UNN8	238 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CHP1-208	ENST00000560965	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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