RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	ASB5	Q8WWX0	329 aa		5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	RFT1	Q96AA3	541 aa		5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	C14orf79	Q96F83	325 aa		5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	LURAP1	Q96LR2	239 aa		5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	OR51M1	Q9H341	326 aa		5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	PROK2	Q9HC23	129 aa		5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		5.84	□□□□□ -1.47
FGD4-215	ENST00000551984	PLSCR5	A0PG75	271 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	ZAR1L	A6NP61	321 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	FAM166B	A8MTA8	275 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984		L7N2F9	121 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	AQP7	O14520	342 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	CASK	O14936	926 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SSNA1	O43805	119 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SUSD5	O60279	629 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984		P04436	131 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SLC35E2	P0CK97	266 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	ELK1	P19419	428 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	DNASE1L1	P49184	302 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	HMGCS1	Q01581	520 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	TFF3	Q07654	80 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	MAP4K2	Q12851	820 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	NUDT13	Q86X67	352 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF527	Q8NB42	609 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	NTNG2	Q96CW9	530 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	FCRL1	Q96LA6	429 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	MIOX	Q9UGB7	285 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SHISA3	A0PJX4	238 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984		G3V3Y1	287 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	PGRMC2	O15173	223 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	HPX	P02790	462 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	TNFRSF1B	P20333	461 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	AHCY	P23526	432 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	S100P	P25815	95 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	CHRNB4	P30926	498 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	S100A3	P33764	101 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	MAGEA5	P43359	124 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	CDH12	P55289	794 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	FABP5	Q01469	135 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	FUT7	Q11130	342 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	GXYLT1	Q4G148	440 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	FRG2	Q64ET8	278 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	RPRML	Q8N4K4	120 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	FRG2B	Q96QU4	278 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	CNIH4	Q9P003	139 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	TACC2	O95359	2948 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984		A0A1W2PS29	197 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	GLOD5	A6NK44	160 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	CLIC1	O00299	241 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	RFXANK	O14593	260 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	T	O15178	435 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	RGS14	O43566	566 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	OR10H2	O60403	315 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	S100A8	P05109	93 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	CELA3A	P09093	270 aa		5.83	□□□□□ -1.48

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms