RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GPRC6AQ5T6X5 926 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM78BQ5VT40 261 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRR27Q6MZM9 219 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TREML4Q6UXN2 200 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NIT1Q86X76 327 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CATSPER3Q86XQ3 398 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TDHQ8IZJ6 230 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ATPAF2Q8N5M1 289 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR4C6Q8NH72 309 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZFP90Q8TF47 636 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 APH1AQ96BI3 265 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAB39BQ96DA2 213 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR10C1Q96KK4 312 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TIMP4Q99727 224 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NUDT9Q9BW91 350 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MS4A8Q9BY19 250 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 REEP4Q9H6H4 257 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NIPAL2Q9H841 368 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CD320Q9NPF0 282 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CD84Q9UIB8 345 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 JPT1Q9UK76 154 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.36□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLA2R1Q13018 1463 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KIF1BO60333 1816 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A1W2PPV9 198 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C20orf202A1L168 122 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR5H14A6NHG9 310 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C17orf100A8MU93 164 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 M0QZQ0 153 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAAHO00519 579 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SNAP91O60641 907 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RAB36O95755 333 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IFNA1P01562 189 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SERPINA7P05543 415 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CSN3P07498 182 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF43P17038 809 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KITLGP21583 273 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SSTR4P31391 388 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LGALS7P47929 136 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TDGF1P3P51864 188 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM50BP56557 158 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TAS2R50P59544 299 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TBPL1P62380 186 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GNG3P63215 75 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZXDBP98169 803 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GTF2H2Q13888 395 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZIC1Q15915 447 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZFP69Q49AA0 526 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PYCR3Q53H96 274 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CEACAM20Q6UY09 585 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GALNT10Q86SR1 603 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GPSM1Q86YR5 675 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR4D9Q8NGE8 314 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR1P1Q8NH06 330 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MYLIPQ8WY64 445 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SNAPC3Q92966 411 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UCN3Q969E3 161 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SMIM19Q96E16 107 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KCTD7Q96MP8 289 aa6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms