RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, human

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF1B-208	ENST00000515588	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	UNC119B	A6NIH7	251 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588		B9A039	149 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	GPRIN2	O60269	458 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	ENTPD5	O75356	428 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	LY6H	O94772	140 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	UBOX5	O94941	541 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	NDUFB2	O95178	105 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	MAGEA2	P43356	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	RAB35	Q15286	201 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC36A2	Q495M3	483 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	DHFR2	Q86XF0	187 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	RASD2	Q96D21	266 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	RBP7	Q96R05	134 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	RNF121	Q9H920	327 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	AURKC	Q9UQB9	309 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	RNF223	E7ERA6	249 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	IMPA2	O14732	288 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	MGRN1	O60291	552 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	LY6G6D	O95868	133 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	SCG5	P05408	212 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	BMP4	P12644	408 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	NR2C1	P13056	603 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	CCL2	P13500	99 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	NPR2	P20594	1047 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	NUDT6	P53370	316 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	SGCA	Q16586	387 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	MTX3	Q5HYI7	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	SVOPL	Q8N434	492 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	FNDC8	Q8TC99	324 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF570	Q96NI8	536 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	DOK1	Q99704	481 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	MUC13	Q9H3R2	512 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	PRSS37	A4D1T9	235 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	ACOT8	O14734	319 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	OR10H3	O60404	316 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF32	P17041	273 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	FPR3	P25089	353 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	LAP3	P28838	519 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	SDHA	P31040	664 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	GSS	P48637	474 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	EFNA4	P52798	201 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	HMGA2	P52926	109 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	FAM27B	Q5VT28	67 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF525	Q8N782	197 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	THTPA	Q9BU02	230 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	REG4	Q9BYZ8	158 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588		A0A1W2PPL8	197 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	SOCS2	O14508	198 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	XKRY	O14609	159 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	TXNDC12	O95881	172 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	CTLA4	P16410	223 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	GLRX	P35754	106 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	PSG4	Q00888	419 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	RFX4	Q33E94	735 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	FANK1	Q8TC84	345 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24

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