RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484918.1

MRPL23-209, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, human

TSL 5

Gene MRPL23, Length 232 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL23-209	ENST00000484918	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918		K7EPI3	171 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918		M0R3G1	203 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF208	O43345	1280 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	FZD7	O75084	574 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	SERPINE1	P05121	402 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	UBL4A	P11441	157 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	CBL	P22681	906 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	MPI	P34949	423 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	MAB21L1	Q13394	359 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	OR7A5	Q15622	319 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	XKR7	Q5GH72	579 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	GRINA	Q7Z429	371 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	LYG2	Q86SG7	212 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	NABP1	Q96AH0	204 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918		M0R1W7	72 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	HSPA4L	O95757	839 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	AHSG	P02765	367 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	GPI	P06744	558 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	IL3	P08700	152 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	IFI6	P09912	130 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	G6PD	P11413	515 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	SERPINB4	P48594	390 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	DYNLT3	P51808	116 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	ATP12A	P54707	1039 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	PPP1CB	P62140	327 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	LIPJ	Q5W064	366 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	KDM8	Q8N371	416 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918		Q8TCH9	128 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	CALML6	Q8TD86	181 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	DDIT4L	Q96D03	193 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	CDRT15	Q96T59	188 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	RASD1	Q9Y272	281 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRPL23-209	ENST00000484918	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	MS4A18	H0YCH9	400 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	LGALS8	O00214	317 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	OVOL1	O14753	267 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	ICMT	O60725	284 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	PRPS2	P11908	318 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	TSPAN8	P19075	237 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	KITLG	P21583	273 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	AHCY	P23526	432 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	GGT2	P36268	569 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	CCNG1	P51959	295 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	4.77	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	SEC23B	Q15437	767 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRPL23-209	ENST00000484918	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		4.77	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms