RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 ASB10Q8WXI3 467 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 FAM162AQ96A26 154 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF583Q96ND8 569 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 RBP7Q96R05 134 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 DECR2Q9NUI1 292 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 MRGBPQ9NV56 204 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 TREM2Q9NZC2 230 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 GPR160Q9UJ42 338 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 V9GYQ6 96 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 ISPDA4D126 451 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 C5orf49A4QMS7 147 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 J3KTA2 159 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 FXYD1O00168 92 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 CXCR6O00574 342 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 LILRA1O75019 489 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 GMNNO75496 209 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 NPPAP01160 153 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 MT-ND5P03915 603 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 COX4I1P13073 169 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 NCK1P16333 377 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF32P17041 273 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 STOMP27105 288 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 GCH1P30793 250 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 RBM34P42696 430 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 GPR4P46093 362 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 GDI2P50395 445 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 NUDT2P50583 147 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 SLC7A2P52569 658 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 CDH15P55291 814 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 UCP2P55851 309 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 SELENOWP63302 87 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 TBPL2Q6SJ96 375 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 OAFQ86UD1 273 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 STON2Q8WXE9 905 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 RDH5Q92781 318 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.31e-7■■■■■ 39.5
CTPS1-209ENST00000480420 PLSCR5A0PG75 271 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 XKRYO14609 159 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 WNT9BO14905 357 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 SPRY3O43610 288 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC22O60826 627 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 FZD7O75084 574 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 NCR1O76036 304 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 SERPINA1P01009 418 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 NR2C1P13056 603 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 MAKP20794 623 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 FUT4P22083 530 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 LAP3P28838 519 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 SLC9A3P48764 834 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 TRAM2Q15035 370 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 TAF11Q15544 211 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 IFI44LQ53G44 452 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 COQ5Q5HYK3 327 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 FGD3Q5JSP0 725 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 THEM4Q5T1C6 240 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 LIPNQ5VXI9 398 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 OTPQ5XKR4 325 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF627Q7L945 461 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 DPPA2Q7Z7J5 298 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 RNF148Q8N7C7 305 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 ABHD4Q8TB40 342 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF519Q8TB69 540 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 YIPF5Q969M3 257 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-209ENST00000480420 PRRC1Q96M27 445 aa6.92□□□□□ -1.3
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