RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 KCNN2Q9H2S1 579 aa22.4■■□□□ 1.18
PBRM1-218ENST00000458294 C7orf69Q9H7B7 122 aa22.4■■□□□ 1.18
PBRM1-218ENST00000458294 ESM1Q9NQ30 184 aa22.4■■□□□ 1.18
PBRM1-218ENST00000458294 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa22.39■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 A0A1W2PRG6 482 aa22.39■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 MCIDASD6RGH6 385 aa22.39■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF718Q3SXZ3 478 aa22.39■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 C10orf128Q5T292 105 aa22.39■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa22.39■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 SLC30A8Q8IWU4 369 aa22.39■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 SIAEQ9HAT2 523 aa22.39■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 NTN4Q9HB63 628 aa22.39■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 PLSCR5A0PG75 271 aa22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 FSHBP01225 129 aa22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 IGHV1-46P01743 117 aa22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 CCNOP22674 350 aa22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 FPR2P25090 351 aa22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 GCH1P30793 250 aa22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 MMP15P51511 669 aa22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 SLC3A1Q07837 685 aa22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 TREML1Q86YW5 311 aa22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 ASB10Q8WXI3 467 aa22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 CCL17Q92583 94 aa22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 TMBIM4Q9HC24 238 aa22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 TRMUO75648 421 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 PRSS23O95084 383 aa22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 ACADSP16219 412 aa22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 MAKP20794 623 aa22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 CD247P20963 164 aa22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 STOMP27105 288 aa22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 DAP3P51398 398 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 UGT2B15P54855 530 aa22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 UBA52P62987 128 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 DHDDSQ86SQ9 333 aa22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 C1orf174Q8IYL3 243 aa22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 SYT14Q8NB59 555 aa22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 PRSS27Q9BQR3 290 aa22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 EGLN1Q9GZT9 426 aa22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 RABEP2Q9H5N1 569 aa22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 CYSLTR2Q9NS75 346 aa22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 OPN4Q9UHM6 478 aa22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 WNK2Q9Y3S1 2297 aa22.37■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 SPRY3O43610 288 aa22.36■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 UBOX5O94941 541 aa22.36■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 F13BP05160 661 aa22.36■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF101Q8IZC7 436 aa22.36■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 SLC26A7Q8TE54 656 aa22.36■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 POM121L2Q96KW2 1035 aa22.36■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 SMURF2Q9HAU4 748 aa22.36■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 TANC2Q9HCD6 1990 aa22.36■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 MGAM2Q2M2H8 2515 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 PPIAL4EA0A075B759 164 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 PPIAL4DF5H284 164 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 MT-ND1P03886 318 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 ADH4P08319 380 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 PPIAL4FP0DN26 164 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 LIPAP38571 399 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 WNT5AP41221 380 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 MTPNP58546 118 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 PRR31Q5SQ13 230 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 THEM4Q5T1C6 240 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 DPP10Q8N608 796 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 LRRC8CQ8TDW0 803 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 ST7LQ8TDW4 575 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 RASSF5Q8WWW0 418 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 NABP1Q96AH0 204 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF747Q9BV97 191 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 INIPQ9NRY2 104 aa22.35■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 ISPDA4D126 451 aa22.34■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF32P17041 273 aa22.34■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 MPV17P39210 176 aa22.34■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 LCN2P80188 198 aa22.34■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 FOXL1Q12952 345 aa22.34■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 SELPLGQ14242 412 aa22.34■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM255AQ5JRV8 349 aa22.34■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 SPATA46Q5T0L3 261 aa22.34■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 SLC25A40Q8TBP6 338 aa22.34■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 TAMM41Q96BW9 452 aa22.34■■□□□ 1.17
PBRM1-218ENST00000458294 CGREF1Q99674 301 aa22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms