RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 OR5H14A6NHG9 310 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 FAM74A7A6NL05 159 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf172C9J069 976 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 H3BML4 177 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFB2O95178 105 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SIX6O95475 246 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 GUSBP08236 651 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 IL9P15248 144 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 HLA-GP17693 338 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 S100PP25815 95 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFS1P28331 727 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 DCTDP32321 178 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CSF2RBP32927 897 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PRSS3P35030 304 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 DIO1P49895 249 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 METAP1P53582 386 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CXADRP78310 365 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CSNK1G2P78368 415 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SORDQ00796 357 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 LTBQ06643 244 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR1Q1Q15612 314 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 HMGN3Q15651 99 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZIC1Q15915 447 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CDNFQ49AH0 187 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TP53I3Q53FA7 332 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 HES5Q5TA89 166 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 AWAT2Q6E213 333 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MFSD12Q6NUT3 480 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM205Q6UW68 189 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SYT13Q7L8C5 426 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 Q8N1Y9 231 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 STOML3Q8TAV4 291 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 THAP6Q8TBB0 222 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CDS1Q92903 461 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 STACQ99469 402 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM2Q9C040 744 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MED20Q9H944 212 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SPHK1Q9NYA1 384 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MOKQ9UQ07 419 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TRPM6Q9BX84 2022 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 WRBO00258 174 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PHYHO14832 338 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 FRS3O43559 492 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF254O75437 659 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ITGB2P05107 769 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 GTF2F2P13984 249 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SPI1P17947 270 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MC3RP41968 323 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF136P52737 540 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PDX1P52945 283 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 STARD6P59095 220 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZP2Q05996 745 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MEF2DQ14814 521 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 RNF212Q495C1 297 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 RPTNQ6XPR3 784 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ACOT4Q8N9L9 421 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.52□□□□□ -1.37
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