RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 FUT4P22083 530 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 STOMP27105 288 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 GDI2P50395 445 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 MMP15P51511 669 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PROK1P58294 105 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVS71-1P61550 626 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PLAURQ03405 335 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CASP8Q14790 479 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CD276Q5ZPR3 534 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ULK3Q6PHR2 472 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 VRK2Q86Y07 508 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6X1Q8NH79 312 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 AGR3Q8TD06 166 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TAAR8Q969N4 342 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 COG8Q96MW5 612 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB18Q99592 522 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 NUF2Q9BZD4 464 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CLN8Q9UBY8 286 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 BTNL2Q9UIR0 455 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.61□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM233B4DJY2 109 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 C5orf58C9J3I9 102 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 E9PBE3 544 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 MS4A18H0YCH9 400 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 DHHO43323 396 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR137BO60478 399 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ANP32DO95626 131 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHG1P01857 330 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 MELTFP08582 738 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PATE4P0C8F1 98 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ADORA3P0DMS8 318 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL2P13500 99 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 IRF2P14316 349 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT4P19013 534 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CBLP22681 906 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 BIDP55957 195 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CLRN1P58418 232 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 RELBQ01201 579 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 EGR4Q05215 589 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 DOC2BQ14184 412 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF11Q15544 211 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 UGT3A2Q3SY77 523 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP85LQ5SZL2 805 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 THEM4Q5T1C6 240 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINA11Q86U17 422 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 MNS1Q8NEH6 495 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC115Q96NT0 180 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 C16orf95Q9H693 158 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 IL19Q9UHD0 177 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.6□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 C5orf49A4QMS7 147 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CENPBD1B2RD01 187 aa6.59□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms