RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619785.1

SENP3-210, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-210ENST00000619785 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 DUSP5Q16690 384 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 FBLN7Q53RD9 439 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 SVOPLQ8N434 492 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PYROXD1Q8WU10 500 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 TMEM45BQ96B21 275 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 OTULINQ96BN8 352 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 FCRL1Q96LA6 429 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ZNF382Q96SR6 550 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 STACQ99469 402 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 MED29Q9NX70 200 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 SENP1Q9P0U3 644 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 SNX12Q9UMY4 172 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 MOKQ9UQ07 419 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PLXNB1O43157 2135 aa6.19□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 CIB4A0PJX0 185 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 J3QLI3 93 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 KRT6AP02538 564 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 KRT6BP04259 564 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 GUSBP08236 651 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 OR4A8P0C604 315 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 MPGP29372 298 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 HSD17B3P37058 310 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 KRT6CP48668 564 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PRPS1P60891 318 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 DR1Q01658 176 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 NAAAQ02083 359 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 TGFBR3Q03167 851 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 CAMK2DQ13557 499 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PDE7AQ13946 482 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 KIAA0040Q15053 153 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 SYT14P1Q58G82 188 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 KLC3Q6P597 504 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 OR51F2Q8NH61 342 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 OR5W2Q8NH69 310 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 FBXO30Q8TB52 745 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PIGXQ8TBF5 258 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 GPR151Q8TDV0 419 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 SLC38A2Q96QD8 506 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 FUT8Q9BYC5 575 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 NTN4Q9HB63 628 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 A0A1W2PR80 420 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 A8MT66 165 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PPIAL4DF5H284 164 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 CCDC188H7C350 402 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 MGST3O14880 152 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 GMFGO60234 142 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 RP2O75695 350 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 OR4F21O95013 312 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ACHEP22303 614 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PRTN3P24158 256 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 NTSP30990 170 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 STX2P32856 288 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ATP12AP54707 1039 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 TMEM33P57088 247 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 SKP2Q13309 424 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 SLC17A1Q14916 467 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 QPRTQ15274 297 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 SGO1Q5FBB7 561 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.17□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PET117Q6UWS5 81 aa6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms