RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 M0R233 179 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 FBP2O00757 339 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 FMO6PO60774 539 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 MT-ATP6P00846 226 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 F13BP05160 661 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM157BP0CG42 384 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCL2P13500 99 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 HNF1AP20823 631 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 NR4A1P22736 598 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 PEX2P28328 305 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERFP50548 548 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAB1AP62820 205 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 GALK2Q01415 458 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 GLO1Q04760 184 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBBP4Q09028 425 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAPRE2Q15555 327 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF74Q16587 644 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 VMACQ2NL98 169 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CR1LQ2VPA4 569 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 LPCAT4Q643R3 524 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 PXKQ7Z7A4 578 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CARM1Q86X55 608 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 SKA3Q8IX90 412 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC36Q8IYA8 594 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 DPP10Q8N608 796 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYT14Q8NB59 555 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR6S1Q8NH40 331 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 PFN4Q8NHR9 129 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRGUKQ96M69 825 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 DOK1Q99704 481 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF121Q9H920 327 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 EFCAB1Q9HAE3 211 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 NANSQ9NR45 359 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM160Q9NX00 188 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 GLTPQ9NZD2 209 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 DUSP13Q9UII6 198 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 GMEB1Q9Y692 573 aa6.18□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 FXYD1O00168 92 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRASO14807 208 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 DHHO43323 396 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYNGR3O43761 229 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 PIP5K1CO60331 668 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 LILRA1O75019 489 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 NCR1O76036 304 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBL3O95164 117 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 BCL10O95999 233 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 HPXP02790 462 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 HIST1H2ABP04908 130 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 NAT2P11245 290 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 FUT1P19526 365 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR1E2P47887 323 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHN2P52757 468 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CRYBA2P53672 197 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 UGT2B15P54855 530 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 AQP4P55087 323 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLRN1P58418 232 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERVS71-1P61550 626 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 RUNX1T1Q06455 604 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 FMODQ06828 376 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 FLOT2Q14254 428 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC36Q1X8D7 754 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 MMEL1Q495T6 779 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM54Q969K7 222 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF566Q969W8 418 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 RCN3Q96D15 328 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRR1Q96L50 414 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF75AQ96N20 296 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms