RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ACANP16112 2415 aa14.49□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 A0A1W2PRG6 482 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 H7C417 338 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 BCL10O95999 233 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 HEXAP06865 529 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 FUT1P19526 365 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 CAPZA2P47755 286 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 CLEC9AQ6UXN8 241 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ZNF813Q6ZN06 617 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 WDFY1Q8IWB7 410 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 IL17RDQ8NFM7 739 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 OR4F15Q8NGB8 312 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 FOXB1Q99853 325 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 C20orf141Q9NUB4 165 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 GLTPQ9NZD2 209 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa14.48□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 NPIPB13A6NJU9 1138 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 CENPBD1B2RD01 187 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 NPIPB4C9JG80 1138 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 G3V2T6 193 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 SEC14L2O76054 403 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 IGHG1P01857 330 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ZNF23P17027 643 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 LIMS1P48059 325 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 MELKQ14680 651 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 GSG1Q2KHT4 349 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 RRM2BQ7LG56 351 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 AMIGO2Q86SJ2 522 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 MDP1Q86V88 176 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 SMR3AQ99954 134 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 INIPQ9NRY2 104 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 CA10Q9NS85 328 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ENOPH1Q9UHY7 261 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.47□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 MCIDASD6RGH6 385 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 H0YJX3 145 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 FFAR1O14842 300 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 TSPAN19P0C672 248 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 PGA4P0DJD7 388 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 PGA3P0DJD8 388 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ANXA8P13928 327 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 B4GALT1P15291 398 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ACVR1BP36896 505 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 VHLP40337 213 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 NPRL3Q12980 569 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 TNK1Q13470 666 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 MICAQ29983 383 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 ICA1LQ8NDH6 482 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 NUP37Q8NFH4 326 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 BPIFA2Q96DR5 249 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 NTN4Q9HB63 628 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 B3GNT2Q9NY97 397 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 OAZ3Q9UMX2 235 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.46□□□□□ -0.09
PKP3-209ENST00000533069 J3KTA2 159 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 NDUFS7O75251 213 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 DIRAS1O95057 198 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 CCNB2O95067 398 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 UBL3O95164 117 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 HLA-HP01893 362 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 F13BP05160 661 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 CELA3BP08861 270 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 CD79AP11912 226 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 SERPINF1P36955 418 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 AQP2P41181 271 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 NUDT6P53370 316 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 CLRN1P58418 232 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 DSCR9P59020 149 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 RAB35Q15286 201 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 RFX4Q33E94 735 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 ANKDD1AQ495B1 522 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 FGD3Q5JSP0 725 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 NOXO1Q8NFA2 376 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 OR4C15Q8NGM1 316 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 GIPC3Q8TF64 312 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 RDH12Q96NR8 316 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa14.45□□□□□ -0.1
PKP3-209ENST00000533069 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms