RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 NHLRC3Q5JS37 347 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 KIRREL2Q6UWL6 708 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM220AQ7Z4H9 259 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC47A2Q86VL8 602 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 XYLT1Q86Y38 959 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 PLXDC1Q8IUK5 500 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 C11orf42Q8N5U0 333 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 MVB12AQ96EY5 273 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC41A3Q96GZ6 507 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 BMFQ96LC9 184 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 OR2M4Q96R27 311 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 MMP28Q9H239 520 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 MSL2Q9HCI7 577 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 ARMCX1Q9P291 453 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 CRLS1Q9UJA2 301 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 OR51B4Q9Y5P0 310 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 ASXL3Q9C0F0 2248 aa4.15□□□□□ -1.74
RABGGTB-213ENST00000496055 OBSL1O75147 1896 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 MYO16Q9Y6X6 1858 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 APC2O95996 2303 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 F6UZH7 168 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 UCHL3P15374 230 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 MYF6P23409 242 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TNFSF10P50591 281 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RIPPLY3P57055 190 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RAB25P57735 213 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 HSF1Q00613 529 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 HMGCS1Q01581 520 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 GUCA2AQ02747 115 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR5I1Q13606 314 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PYCR3Q53H96 274 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF789Q5FWF6 425 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CASP12Q6UXS9 341 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 LILRA2Q8N149 483 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR13J1Q8NGT2 312 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SMPDL3BQ92485 455 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 BPIFA2Q96DR5 249 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 C3orf30Q96M34 536 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RSRP1Q9BUV0 290 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf198Q9H425 327 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SCN3BQ9NY72 215 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PKP3Q9Y446 797 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 A3GALT2U3KPV4 340 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDH15Q96QU1 1955 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 MYOFQ9NZM1 2061 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 FIGNL2A6NMB9 653 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SCELO95171 688 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ACTL6AO96019 429 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 CDKN2DP55273 166 aa4.15□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 RAB32Q13637 225 aa4.15□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF773Q6PK81 442 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 DRAM2Q6UX65 266 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PRSS48Q7RTY5 328 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 MIER2Q8N344 545 aa4.15□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 OR51S1Q8NGJ8 323 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR2T4Q8NH00 348 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR5R1Q8NH85 324 aa4.15□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 DUX5Q96PT3 197 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 C20orf85Q9H1P6 137 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ACTR8Q9H981 624 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR14J1Q9UGF5 321 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PRSS21Q9Y6M0 314 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CROCCQ5TZA2 2017 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CDIPTO14735 213 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 HPP00738 406 aa4.14□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 VIPP01282 170 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 JCHAINP01591 159 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CD2P06729 351 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CTSLP07711 333 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CALCRP30988 508 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ACVRL1P37023 503 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ETV6P41212 452 aa4.14□□□□□ -1.75
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