RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	SLC22A5	O76082	557 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	RAD52	P43351	418 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	ARL4D	P49703	201 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	MEP1B	Q16820	701 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	LINC00303	Q3SY05	128 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	D2HGDH	Q8N465	521 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF576	Q9H609	170 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TOM1-210	ENST00000449058	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TNFRSF10A	O00220	468 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ICMT	O60725	284 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	NDUFB6	O95139	128 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ROM1	Q03395	351 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ODF4	Q2M2E3	257 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TEX30	Q5JUR7	227 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR8K3	Q8NH51	312 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	GPR119	Q8TDV5	335 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	RNF128	Q8TEB7	428 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PIGK	Q92643	395 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	NXPE2	Q96DL1	559 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SEC16A	O15027	2179 aa		15.27	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR6C76	A6NM76	312 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058		A8MVM7	634 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	IGHM	P01871	453 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CPN1	P15169	458 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	FOLR1	P15328	257 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CENPA	P49450	140 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	BLVRA	P53004	296 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	P2RX3	P56373	397 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SPIC	Q8N5J4	248 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	C8orf44	Q96CB5	159 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058		H7C417	338 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ADAM10	O14672	748 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PIAS2	O75928	621 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	HLA-DQA2	P01906	255 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ALDOB	P05062	364 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OTP	Q5XKR4	325 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	LINC00862	A6NCI5	91 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TTLL8	A6PVC2	850 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	LEUTX	A8MZ59	168 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058		H3BSH0	61 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SLC16A7	O60669	478 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PNP	P00491	289 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	IL5	P05113	134 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	IFNGR1	P15260	489 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	GRINA	Q7Z429	371 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ADAMTS20	P59510	1910 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TRIO	O75962	3097 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058		A0A0C4DFX4	3053 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	GGT3P	A6NGU5	568 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PLPP3	O14495	311 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CTAG2	O75638	210 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CTLA4	P16410	223 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CSF2RB	P32927	897 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF81	P51508	661 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	EFNB2	P52799	333 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ESCO2	Q56NI9	601 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	STK35	Q8TDR2	534 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03

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