RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598594.1

PAF1-208, Transcript of PAF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component, human

TSL 2

Gene PAF1, Length 280 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SAXO2	Q658L1	398 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	OR2L13	Q8N349	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	NATD1	Q8N6N6	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	OR51A7	Q8NH64	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF597	Q96LX8	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	CPXM1	Q96SM3	734 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ARL6	Q9H0F7	186 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RHOF	Q9HBH0	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	NTM	Q9P121	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	MSH6	P52701	1360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594		A0A0G2JK05	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TSPAN11	A1L157	253 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594		A6NIZ1	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SYCE1L	A8MT33	242 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	HACD1	B0YJ81	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	HSD17B6	O14756	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PI15	O43692	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RAD1	O60671	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ALOX12B	O75342	701 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	KRT75	O95678	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SNAP29	O95721	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	IFNA16	P05015	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	CD5	P06127	495 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	C2	P06681	752 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TFPT	P0C1Z6	253 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SHMT2	P34897	504 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SSTR5	P35346	364 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	BACE1	P56817	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TAS2R60	P59551	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RAB40B	Q12829	278 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	KIR2DS1	Q14954	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ACER2	Q5QJU3	275 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	DTX1	Q86Y01	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	NRM	Q8IXM6	262 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	CAPNS2	Q96L46	248 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594		Q96MT0	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	DDA1	Q9BW61	102 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PAK5	Q9P286	719 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RAB26	Q9ULW5	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	FLT4	P35916	1363 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594		A0A1B0GU03	582 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	GJE1	A6NN92	205 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ANHX	E9PGG2	379 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594		H3BMQ9	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PFDN6	O15212	129 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SIGLEC5	O15389	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	BIRC5	O15392	142 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	DPM1	O60762	260 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms