RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 STMN3Q9NZ72 180 aa25.46■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DKKL1Q9UK85 242 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC16A7O60669 478 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1-210ENST00000574322 SULT1C4O75897 302 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1-210ENST00000574322 CTLA4P16410 223 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1-210ENST00000574322 SRD5A2P31213 254 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC35A1P78382 337 aa25.46■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TVP23AA6NH52 213 aa25.45■■□□□ 1.66
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CTDNEP1-210ENST00000574322 G3V3Y1 287 aa25.45■■□□□ 1.66
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CTDNEP1-210ENST00000574322 OR2B6P58173 313 aa25.45■■□□□ 1.66
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CTDNEP1-210ENST00000574322 C16orf87Q6PH81 154 aa25.45■■□□□ 1.66
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ANKRD10Q9NXR5 420 aa25.45■■□□□ 1.66
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DNASE1L1P49184 302 aa25.44■■□□□ 1.66
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF45Q02386 682 aa25.44■■□□□ 1.66
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CTDNEP1-210ENST00000574322 HSPB2Q16082 182 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-210ENST00000574322 DNM1P34Q6PK57 102 aa25.44■■□□□ 1.66
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CTDNEP1-210ENST00000574322 OTOSQ8NHW6 89 aa25.44■■□□□ 1.66
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TPK1Q9H3S4 243 aa25.44■■□□□ 1.66
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CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A1W2PRS3 328 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIR3DP1A8MWS1 328 aa25.43■■□□□ 1.66
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DPY19L4Q7Z388 723 aa25.43■■□□□ 1.66
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TXNDC15Q96J42 360 aa25.43■■□□□ 1.66
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CTDSP2O14595 271 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-210ENST00000574322 OPN1LWP04000 364 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-210ENST00000574322 LIPCP11150 499 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-210ENST00000574322 GDI2P50395 445 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-210ENST00000574322 B3GALT5-AS1P59052 145 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-210ENST00000574322 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-210ENST00000574322 ABHD17BQ5VST6 288 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-210ENST00000574322 HDDC2Q7Z4H3 204 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-210ENST00000574322 WDFY2Q96P53 400 aa25.42■■□□□ 1.66
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