RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561992.5

TCF4-211, Transcript of transcription factor 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TCF4, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4-211ENST00000561992 ZDHHC22Q8N966 263 aa9□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 ARL11Q969Q4 196 aa9□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 CTHRC1Q96CG8 243 aa9□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 TWSG1Q9GZX9 223 aa9□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 TMEM100Q9NV29 134 aa9□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa9□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 TRAV18A0A075B6X5 111 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 IGLON5A6NGN9 336 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 F8VVB4 439 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 F8VWA3 439 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 FGF18O76093 207 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 CD3DP04234 171 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 DLSTP36957 453 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 CENPAP49450 140 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 LUMP51884 338 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 MGAT2Q10469 447 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 CCINQ13939 588 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 RUNX2Q13950 521 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 KIR2DS3Q14952 304 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 GUCA2BQ16661 112 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 PHF19Q5T6S3 580 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 STPG1Q5TH74 334 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 ELP2Q6IA86 826 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 FAM166AQ6J272 317 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 FAM122BQ7Z309 247 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 DEFB128Q7Z7B8 93 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 OR2G2Q8NGZ5 317 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 SUSD6Q92537 303 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 PRRT1Q99946 306 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 SEC11CQ9BY50 192 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 WDR76Q9H967 626 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 IL21RQ9HBE5 538 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 ZFP57Q9NU63 452 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 DEC1Q9P2X7 70 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 CTSFQ9UBX1 484 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 H0YC42 278 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 DOK2O60496 412 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 GNRH1P01148 92 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 IL2RAP01589 272 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 CD14P08571 375 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 PNMTP11086 282 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 PTHLHP12272 177 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 FOLR2P14207 255 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 ACHEP22303 614 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 TACR3P29371 465 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 POU3F4P49335 361 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 CXADRP78310 365 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 ZNF528Q3MIS6 628 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 LEG1Q6P5S2 330 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 ZNF676Q8N7Q3 588 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 OR51L1Q8NGJ5 315 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 THAP6Q8TBB0 222 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 NXPE3Q969Y0 559 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 G6PC3Q9BUM1 346 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 SYNPO2LQ9H987 977 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 FBXO34Q9NWN3 711 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 SPHK1Q9NYA1 384 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 PCDHB10Q9UN67 800 aa8.99□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 MEGF11A6BM72 1044 aa8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 OR6C74A6NCV1 312 aa8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 NPIPB9F8W1W9 429 aa8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 S100A8P05109 93 aa8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 INHAP05111 366 aa8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 POU2F2P09086 479 aa8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 OR8G3PP0DMU2 310 aa8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 CD79AP11912 226 aa8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 SDHAP31040 664 aa8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 CASRP41180 1078 aa8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 GRK6P43250 576 aa8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 ZNF234Q14588 700 aa8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 GRM7Q14831 915 aa8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 AVPI1Q5T686 147 aa8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
TCF4-211ENST00000561992 KIRREL2Q6UWL6 708 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms