RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 USP51Q70EK9 711 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 RRM2BQ7LG56 351 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 OR5AS1Q8N127 324 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CBR4Q8N4T8 237 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 KCNN3Q9UGI6 736 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ABCG2Q9UNQ0 655 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 TIPRLO75663 272 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 NAT2P11245 290 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CHMP24386 653 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 POU1F1P28069 291 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 SLC1A3P43003 542 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 SLC16A1P53985 500 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 GALK2Q01415 458 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 MAPRE2Q15555 327 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 OR1Q1Q15612 314 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 SAXO2Q658L1 398 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 OR2A2Q6IF42 318 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 MUC15Q8N387 334 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 FBXW5Q969U6 566 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CDHR4A6H8M9 788 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ADAMDEC1O15204 470 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 KLF4O43474 513 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 RAF1P04049 648 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 NGFRP08138 427 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 SERPINB10P48595 397 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 MVDP53602 400 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 MVKQ03426 396 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 GNA13Q14344 377 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CORO6Q6QEF8 472 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 BEND4Q6ZU67 534 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 LINGO2Q7L985 606 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 GRINAQ7Z429 371 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 MISPQ8IVT2 679 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 MDFIQ99750 246 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 TRIM15Q9C019 465 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 NTMQ9P121 344 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CD300AQ9UGN4 299 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CACNG2Q9Y698 323 aa6.61□□□□□ -1.35
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CS-212ENST00000548567 H0YAE9 185 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 MPZL1O95297 269 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 TGFAP01135 160 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 HLA-DQA2P01906 255 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 KRT8P05787 483 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CD53P19397 219 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CD40LGP29965 261 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CTAG1AP78358 180 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 AQP6Q13520 282 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 HYAL4Q2M3T9 481 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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CS-212ENST00000548567 NANSQ9NR45 359 aa6.6□□□□□ -1.35
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CS-212ENST00000548567 RCE1Q9Y256 329 aa6.6□□□□□ -1.35
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CS-212ENST00000548567 CDK2AP1O14519 115 aa6.6□□□□□ -1.35
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CS-212ENST00000548567 GYPBP06028 91 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 CYC1P08574 325 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 FCGR1AP12314 374 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 BMP4P12644 408 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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CS-212ENST00000548567 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 EGR4Q05215 589 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-212ENST00000548567 FGFBP1Q14512 234 aa6.6□□□□□ -1.35
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