RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 IL20Q9NYY1 176 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 CENPEQ02224 2701 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 ARPC3O15145 178 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 DHHO43323 396 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 CTAG2O75638 210 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 TXNDC12O95881 172 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 QDPRP09417 244 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 ARF1P84077 181 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 CD47Q08722 323 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 PHYHD1Q5SRE7 291 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 KLHL17Q6TDP4 642 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 WFDC8Q8IUA0 241 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 FEVQ99581 238 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 RASSF1Q9NS23 344 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC25A15Q9Y619 301 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 FXYD6P3P58550 94 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 TBRG1Q3YBR2 411 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 C10orf128Q5T292 105 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 THSD4Q6ZMP0 1018 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 HIPK1Q86Z02 1210 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 OR5K1Q8NHB7 308 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 MCHR2Q969V1 340 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 FOXB1Q99853 325 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 IFT27Q9BW83 186 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 BAIAP2Q9UQB8 552 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-212ENST00000508338 CELSR2Q9HCU4 2923 aa23.51■■□□□ 1.35
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SH3BP2-212ENST00000508338 IST1P53990 364 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 RUNX1T1Q06455 604 aa23.51■■□□□ 1.35
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SH3BP2-212ENST00000508338 LRFN4Q6PJG9 635 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 C22orf34Q6ZV56 151 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 DPPA2Q7Z7J5 298 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM200AQ86VY9 491 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 WDFY1Q8IWB7 410 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 SYT14Q8NB59 555 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
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SH3BP2-212ENST00000508338 Q96M85 177 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 NTN4Q9HB63 628 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 FARS2O95363 451 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 NOS3P29474 1203 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF813Q6ZN06 617 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 SVOPLQ8N434 492 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM169BQ8N8A8 192 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 WDR31Q8NA23 367 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 OR52N5Q8NH56 324 aa23.5■■□□□ 1.35
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SH3BP2-212ENST00000508338 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
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SH3BP2-212ENST00000508338 PRSS37A4D1T9 235 aa23.49■■□□□ 1.35
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SH3BP2-212ENST00000508338 NPR2P20594 1047 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 C3orf36Q3SXR2 165 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 HIKESHIQ53FT3 197 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 OSBPL10Q9BXB5 764 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 TBC1D23Q9NUY8 699 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 KIF17Q9P2E2 1029 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 IL20RAQ9UHF4 553 aa23.49■■□□□ 1.35
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SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM108Q6UXF1 575 aa23.48■■□□□ 1.35
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SH3BP2-212ENST00000508338 ATG16L2Q8NAA4 619 aa23.48■■□□□ 1.35
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SH3BP2-212ENST00000508338 PIK3IP1Q96FE7 263 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa23.48■■□□□ 1.35
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SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM38BQ9NVV0 291 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 FBXL3Q9UKT7 428 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 EDARQ9UNE0 448 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 ABCA4P78363 2273 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A096LPE4 126 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1W2PPZ6 126 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP1R3DO95685 299 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 PTAFRP25105 342 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 ALKBH2Q6NS38 261 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 DNM1P34Q6PK57 102 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2T33Q8NG76 320 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 TEX47Q8TBZ9 253 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 LRTOMTQ8WZ04 291 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-212ENST00000508338 PLPPR2Q96GM1 343 aa23.47■■□□□ 1.35
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