RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 PRPSAP1Q14558 356 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 RNF212Q495C1 297 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ASRGL1Q7L266 308 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 UEVLDQ8IX04 471 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 LRRC18Q8N456 261 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 BMPERQ8N8U9 685 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 CD200R1Q8TD46 325 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 TFAP2CQ92754 450 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 UFD1Q92890 307 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 UHRF2Q96PU4 802 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 GFI1Q99684 422 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 APOL4Q9BPW4 351 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 NUDT9Q9BW91 350 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 SDCBP2Q9H190 292 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 RNF121Q9H920 327 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 TXNRD2Q9NNW7 524 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 IL36GQ9NZH8 169 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.45□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 MST1RQ04912 1400 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 EVPLLA8MZ36 301 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 PROB1E7EW31 1015 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 PHYHO14832 338 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 FGF16O43320 207 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 TTC4O95801 387 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 FAM107AO95990 144 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 IGF1P05019 195 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 WNT2P09544 360 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 CT62P0C5K7 136 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 UGT2B7P16662 529 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 NDUFB7P17568 137 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 HTR1FP30939 366 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 SFTPDP35247 375 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 NSG1P42857 185 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 STC1P52823 247 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 CLDN20P56880 219 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 TCTAP57738 103 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 CD81P60033 236 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 KIR2DS1Q14954 304 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 PYCR3Q53H96 274 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 CEACAM20Q6UY09 585 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 Q6ZNX1 250 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 Q6ZSR9 355 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 CYB5R4Q7L1T6 521 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ISCA2Q86U28 154 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 OR10G3Q8NGC4 313 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 ITFG1Q8TB96 612 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 UBE2E3Q969T4 207 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 FAM136AQ96C01 138 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 HBEGFQ99075 208 aa6.44□□□□□ -1.38
PDCD4-211ENST00000498367 SYT3Q9BQG1 590 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms