RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494570.1

KDM4C-211, Transcript of lysine demethylase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene KDM4C, Length 647 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4C-211ENST00000494570 CALCRP30988 508 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 OMPP47874 163 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 LIMS1P48059 325 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 FXYD6P3P58550 94 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 PRPS1P60891 318 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 IL1RL1Q01638 556 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 MST1LQ2TV78 715 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 SPATS1Q496A3 300 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 C16orf89Q6UX73 402 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 DTX2Q86UW9 622 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 GPR137CQ8N3F9 429 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 ASB10Q8WXI3 467 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 PIGTQ969N2 578 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 CCL19Q99731 98 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 GLTPQ9NZD2 209 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 TRAV27A0A087WT01 109 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 HTR3EA5X5Y0 456 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF726A6NNF4 738 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 ACOT8O14734 319 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 PDE5AO76074 875 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 OR6A2O95222 327 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 BCL10O95999 233 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 IGHMP01871 453 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 HLA-HP01893 362 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 HIST1H2ABP04908 130 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 CECR9P0C854 216 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 UMPSP11172 480 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 CBR1P16152 277 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 CALB2P22676 271 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 GPR4P46093 362 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 CSNK1A1P48729 337 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 PTH2RP49190 550 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 MNAT1P51948 309 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 CDH11P55287 796 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 HGFACQ04756 655 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 KLHL24Q6TFL4 600 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF730Q6ZMV8 503 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 ZER1Q7Z7L7 766 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 MDP1Q86V88 176 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 IGFN1Q86VF2 1251 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 OR51A7Q8NH64 312 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF519Q8TB69 540 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 BCAS4Q8TDM0 211 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 HTRA1Q92743 480 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 FBXW5Q969U6 566 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 MCHR2Q969V1 340 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 RADILQ96JH8 1075 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 NSMCE2Q96MF7 247 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF347Q96SE7 839 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 ULBP2Q9BZM5 246 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 IL1RAPQ9NPH3 570 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 INIPQ9NRY2 104 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 ACTR3BQ9P1U1 418 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 EDARQ9UNE0 448 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 V9GYQ6 96 aa7.13□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 SH3PXD2BA1X283 911 aa7.12□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 EFCAB9A8MZ26 197 aa7.12□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 CENPBD1B2RD01 187 aa7.12□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 MCIDASD6RGH6 385 aa7.12□□□□□ -1.27
KDM4C-211ENST00000494570 DHHO43323 396 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms