RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 ACTL6AO96019 429 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM225BP0DP42 221 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 TNFSF4P23510 183 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 CFHR1Q03591 330 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 DCXRQ7Z4W1 244 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 CST11Q9H112 138 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 LHX6Q9UPM6 363 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 TPRP12270 2363 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 DHHO43323 396 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 SGCEO43556 437 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 TSPAN2O60636 221 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 FZD7O75084 574 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 CD96P40200 585 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 SOX8P57073 446 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 GNG2P59768 71 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 FAPQ12884 760 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 CPNE5Q9HCH3 593 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 TRAPPC4Q9Y296 219 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 PCM1Q15154 2024 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 PI4KAP42356 2102 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 DLGAP1O14490 977 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 BMP4P12644 408 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 HTR2AP28223 471 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 TGFBR2P37173 567 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 RAC3P60763 192 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 FHL5Q5TD97 284 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 OR2M7Q8NG81 312 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 OR10D3Q8NH80 312 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF878C9JN71 531 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 DOK2O60496 412 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 SELENOFO60613 162 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF254O75437 659 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 SLC2A10O95528 541 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 PLATP00750 562 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 IGKV3-11P04433 115 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 NCS1P62166 190 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 ARL6IP1Q15041 203 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 RSU1Q15404 277 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 SLC38A9Q8NBW4 561 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 OR2M3Q8NG83 312 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 ADIPOR1Q96A54 375 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 AICDAQ9GZX7 198 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 FAM186AA6NE01 2351 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM129A0AVI4 362 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 DVL2O14641 736 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 IGKV1D-16P01601 117 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 GUSBP08236 651 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 GABRA5P31644 462 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 ID4P47928 161 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 CLN3Q13286 438 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 BTN2A1Q7KYR7 527 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 OR5M9Q8NGP3 310 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 ACTR6Q9GZN1 396 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 OR51B6Q9H340 312 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 FLRT3Q9NZU0 649 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 GMEB1Q9Y692 573 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 SCGNO76038 276 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 CELA2AP08217 269 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 GABRA1P14867 456 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 ARR3P36575 388 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 MGAT2Q10469 447 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 CEP78Q5JTW2 689 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 SNX29P2Q8IUI4 249 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 TOMM5Q8N4H5 51 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
PTPRD-211ENST00000486161 ASXL3Q9C0F0 2248 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 SSNA1O43805 119 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF17P17021 662 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRD-211ENST00000486161 FXNQ16595 210 aa7.46□□□□□ -1.22
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