RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 COL6A5A8TX70 2615 aa11.27□□□□□ -0.6
HPS1-211ENST00000478087 DNHD1Q96M86 4753 aa11.27□□□□□ -0.6
HPS1-211ENST00000478087 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 TMEM129A0AVI4 362 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 ZNF726A6NNF4 738 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 EBAG9O00559 213 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 CD79AP11912 226 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 B4GALT1P15291 398 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 RHCEP18577 417 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 FUT1P19526 365 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 EFNA4P52798 201 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 UGT2B15P54855 530 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 PPP2R2BQ00005 443 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 CHRNB3Q05901 458 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 RUNX1T1Q06455 604 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 MSMPQ1L6U9 139 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 LRFN4Q6PJG9 635 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 ZNF813Q6ZN06 617 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 SLC35D2Q76EJ3 337 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 VTCN1Q7Z7D3 282 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 FAM156AQ8NDB6 213 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 ANKK1Q8NFD2 765 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 OR6N1Q8NGY5 312 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 PFN4Q8NHR9 129 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 TMEM255BQ8WV15 326 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 LRR1Q96L50 414 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 MDFIQ99750 246 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 KCNS3Q9BQ31 491 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 ZNF426Q9BUY5 554 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 FNDC11Q9BVV2 318 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 YAE1D1Q9NRH1 226 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 C20orf141Q9NUB4 165 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 ENPP4Q9Y6X5 453 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.618e-8■■□□□ 14.2
HPS1-211ENST00000478087 SH3PXD2BA1X283 911 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 RNF13O43567 381 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 OR6A2O95222 327 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 F12P00748 615 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 ASAH2BP0C7U1 165 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 ZP4Q12836 540 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 TRAM2Q15035 370 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 C3orf36Q3SXR2 165 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 KRT80Q6KB66 452 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 CLEC2AQ6UVW9 174 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 CCDC121Q6ZUS5 278 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 SKA3Q8IX90 412 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 FAM169BQ8N8A8 192 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 C10orf105Q8TEF2 133 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 FAM168AQ92567 244 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 TMEM54Q969K7 222 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 ZNF347Q96SE7 839 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 ULBP2Q9BZM5 246 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 MAGIXQ9H6Y5 334 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 NANSQ9NR45 359 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 A4GNTQ9UNA3 340 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 POFUT2Q9Y2G5 429 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 MED31Q9Y3C7 131 aa11.26□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 AQP12BA6NM10 295 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 CD5LO43866 347 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 PIP5K1CO60331 668 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 CRLF1O75462 422 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 F13BP05160 661 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 FABP3P05413 133 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 UMPSP11172 480 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 ARR3P36575 388 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 YAP1P46937 504 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 CSNK1A1P48729 337 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 MYBPC1Q00872 1141 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 LAPTM4AQ15012 233 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 PGM2L1Q6PCE3 622 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 RRM2BQ7LG56 351 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 AQP12AQ8IXF9 295 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 SVOPLQ8N434 492 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 OR6X1Q8NH79 312 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 MOSPD2Q8NHP6 518 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 TMEM239Q8WW34 195 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 FOXN4Q96NZ1 517 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 DOK1Q99704 481 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 FOXB1Q99853 325 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 SH3GL3Q99963 347 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 PLK3Q9H4B4 646 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 IL1RAPQ9NPH3 570 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 GLTPQ9NZD2 209 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 ZNF229Q9UJW7 825 aa11.25□□□□□ -0.61
HPS1-211ENST00000478087 MXRA5Q9NR99 2828 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms