RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 ZG16BQ96DA0 208 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 TBX5Q99593 518 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 MAGIXQ9H6Y5 334 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 A0A0J9YW62 118 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 SEC14L2O76054 403 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 RPP14O95059 124 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 ADAP00813 363 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 OR8G3PP0DMU2 310 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 CDH11P55287 796 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 MZT1Q08AG7 82 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 ZMAT1Q5H9K5 638 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 SHFQ7M4L6 423 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 YIPF7Q8N8F6 280 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 LRTOMTQ8WZ04 291 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 AICDAQ9GZX7 198 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 OR52D1Q9H346 318 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 C12orf10Q9HB07 376 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 MED29Q9NX70 200 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 FAM171A2A8MVW0 826 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 DNPH1O43598 174 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 IFI6P09912 130 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 DNASE1P24855 282 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 GNG2P59768 71 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 P2RY6Q15077 328 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 OR51L1Q8NGJ5 315 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 OBP2BQ9NPH6 170 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 TAS2R16Q9NYV7 291 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 KCNN3Q9UGI6 736 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa8.32□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 FANCMQ8IYD8 2048 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF208O43345 1280 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 QDPRP09417 244 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 PRKACGP22612 351 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 ARR3P36575 388 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 FABP6P51161 128 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 PPP3R1P63098 170 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 CBR4Q8N4T8 237 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 OR6K3Q8NGY3 331 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 ST8SIA2Q92186 375 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 FEVQ99581 238 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 AIFM2Q9BRQ8 373 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 GLS2Q9UI32 602 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 MED12Q93074 2177 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 SH3D21A4FU49 640 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 ZNHIT1O43257 154 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 DHHO43323 396 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 PPA1Q15181 289 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 PLPPR5Q32ZL2 321 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 BEX5Q5H9J7 111 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 LYPD8Q6UX82 237 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 PACRGLQ8N7B6 248 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM255BQ8WV15 326 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 ZFP57Q9NU63 452 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 NTNG1Q9Y2I2 539 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 CDH10Q9Y6N8 788 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 FAM25EA8MYX2 175 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 FADS1O60427 444 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 EPPINO95925 133 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 GLAP06280 429 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 CD79BP40259 229 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 CA7P43166 264 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 VASNQ6EMK4 673 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 SLC18B1Q6NT16 456 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 ADCK1Q86TW2 530 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 C3orf49Q96BT1 292 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 ACTR6Q9GZN1 396 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 GORASP2Q9H8Y8 452 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF229Q9UJW7 825 aa8.31□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8.3□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 A0A087WUJ7 227 aa8.3□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 A0A0G2JMM0 328 aa8.3□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 A0A1W2PPB8 328 aa8.3□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 A0A1W2PRS3 328 aa8.3□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 POM121CA8CG34 1229 aa8.3□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 KIR3DP1A8MWS1 328 aa8.3□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 INPP1P49441 399 aa8.3□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 B2MP61769 119 aa8.3□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
DDX39B-215ENST00000462256 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms