RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426248.7

PKP4-205, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PKP4, Length 4,134 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-205ENST00000426248 A0A1B0GUH1 482 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 SELLP14151 372 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 HCCSP53701 268 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 HACD4Q5VWC8 232 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 C12orf73Q69YU5 71 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 KRT77Q7Z794 578 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 SLC35F3Q8IY50 421 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 THAP4Q8WY91 577 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 SLC25A28Q96A46 364 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 C16orf58Q96GQ5 468 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 TCTN2Q96GX1 697 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 C20orf24Q9BUV8 137 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 DUSP23Q9BVJ7 150 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 ZNF350Q9GZX5 532 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 FAM96BQ9Y3D0 163 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 P2RX6O15547 441 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 CAPZBP47756 277 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 DYRK1AQ13627 763 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 NDUFAF7Q7L592 441 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 METTL21AQ8WXB1 218 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 SOSTQ9BQB4 213 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 SCN2AQ99250 2005 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 EMC8O43402 210 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 TXNDC12O95881 172 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 FAM111BQ6SJ93 734 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 FGF21Q9NSA1 209 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 FFAR1O14842 300 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 SAGP10523 405 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 NR0B2Q15466 257 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 PCGF3Q3KNV8 242 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 OR2W3Q7Z3T1 314 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 WDR34Q96EX3 536 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 PRO1933Q9H354 126 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 TMEM74BQ9NUR3 256 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 R4GN57 208 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 TLCD2A6NGC4 264 aa14.58□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 DUXAA6NLW8 204 aa14.58□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 M0R296 226 aa14.58□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 SLC2A10O95528 541 aa14.58□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 MT-ND5P03915 603 aa14.58□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 ADH7P40394 386 aa14.58□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 VN1R4Q7Z5H5 301 aa14.58□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 HORMAD2Q8N7B1 307 aa14.58□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 WDR45Q9Y484 360 aa14.58□□□□□ -0.07
PKP4-205ENST00000426248 GABRA3P34903 492 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 SYPL1Q16563 259 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 FCRLAQ7L513 359 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 PCED1AQ9H1Q7 454 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 MED9Q9NWA0 146 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 ADAM29Q9UKF5 820 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 PRPH2P23942 346 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 OMPP47874 163 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 OR7A5Q15622 319 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 ZNF311Q5JNZ3 666 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 FCRLBQ6BAA4 426 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 TLNRD1Q9H1K6 362 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 DPM1O60762 260 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 SCN2BO60939 215 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 GTF2F2P13984 249 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 ARSGQ96EG1 525 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 AMDHD1Q96NU7 426 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 CCSO14618 274 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 SLC25A12O75746 678 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 LSSP48449 732 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 CEBPGP53567 150 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 NSDHLQ15738 373 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 OR52W1Q6IF63 320 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 OR1J4Q8NGS1 313 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 ABHD4Q8TB40 342 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 PIGXQ8TBF5 258 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 ISOC2Q96AB3 205 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 OR2A5Q96R48 311 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 NUDT22Q9BRQ3 303 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa14.57□□□□□ -0.08
PKP4-205ENST00000426248 SYT5O00445 386 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms