RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 C12orf10Q9HB07 376 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 SIGLEC7Q9Y286 467 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 MED31Q9Y3C7 131 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 FGF17O60258 216 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 PEX14O75381 377 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 AK1P00568 194 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 NID1P14543 1247 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 CXCL3P19876 107 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFRSF17Q02223 184 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2NLQ5JXB2 153 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM27D1Q5T7N8 215 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF595Q8IYB9 648 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 FDCSPQ8NFU4 85 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 BPIFA2Q96DR5 249 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 IP6K3Q96PC2 410 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 MAB21L2Q9Y586 359 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 CDHR4A6H8M9 788 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 SSNA1O43805 119 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 REM1O75628 298 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 LYPD3O95274 346 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 CD3GP09693 182 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF613Q6PF04 617 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFAF7Q7L592 441 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM71CQ8NEG0 241 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4K14Q8NGD5 310 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 DOK4Q8TEW6 326 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ABHD17AQ96GS6 310 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 IMMP1LQ96LU5 166 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 MRI1Q9BV20 369 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 HCAR1Q9BXC0 346 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF700Q9H0M5 742 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 CTNSO60931 367 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 IFI6P09912 130 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 UCHL1P09936 223 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 NT5EP21589 574 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 HSD17B7P56937 341 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 DGCR2P98153 550 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 LTB4RQ15722 352 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ELFN2Q5R3F8 820 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM111BQ6SJ93 734 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 POMGNT2Q8NAT1 580 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF527Q8NB42 609 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 UXS1Q8NBZ7 420 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM19Q96E16 107 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 CLDN4O14493 209 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 LCN1P31025 176 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF81P51508 661 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 FGFBP1Q14512 234 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL11BQ5VVY1 283 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 RTL4Q6ZR62 310 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 C17orf47Q8NEP4 570 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 OMA1Q96E52 524 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDT9Q9BW91 350 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 BRD7Q9NPI1 651 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 POLE3Q9NRF9 147 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 SULT1B1O43704 296 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 PTP4A3O75365 173 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 OR7A10O76100 309 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 RRASP10301 218 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ATF1P18846 271 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC16A1P53985 500 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 OR12D2P58182 307 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 CDONQ4KMG0 1287 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 COMMD7Q86VX2 200 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC38A6Q8IZM9 456 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNT16Q8N428 558 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC1AQ8NC01 280 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFP3Q96NJ6 502 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF559Q9BR84 538 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51V1Q9H2C8 321 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 NANSQ9NR45 359 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 DUSP22Q9NRW4 184 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 MMACHCQ9Y4U1 282 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF879B4DU55 563 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 I3L521 148 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 HPP00738 406 aa23.78■■□□□ 1.4
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