RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239367.6

LRP11-201, Transcript of LDL receptor related protein 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP11, Length 3,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP11-201ENST00000239367 MPGP29372 298 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 CALCRP30988 508 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 PRSS3P35030 304 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 CLINT1Q14677 625 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 OR4E2Q8NGC2 313 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 PHYHIPQ92561 330 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 PRSS16Q9NQE7 514 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 MCIDASD6RGH6 385 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 FOSL1P15407 271 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 PRKXP51817 358 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 PPP2CBP62714 309 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 UBA52P62987 128 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 PPP2CAP67775 309 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 TMEM205Q6UW68 189 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 PMM1Q92871 262 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 CHRDQ9H2X0 955 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 APMAPQ9HDC9 416 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 NOTCH4Q99466 2003 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 TMEM127O75204 238 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 CPMP14384 443 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 ST6GAL1P15907 406 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 MGMTP16455 207 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 PGDP52209 483 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 GAB4Q2WGN9 574 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 ALG10BQ5I7T1 473 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 DCST2Q5T1A1 773 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 FAM220AQ7Z4H9 259 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 EID2Q8N6I1 236 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 CHST4Q8NCG5 386 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 PPP1R14AQ96A00 147 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 HAVCR1Q96D42 359 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 C14orf79Q96F83 325 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 LRFN5Q96NI6 719 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 MYADMQ96S97 322 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 DCDC2BA2VCK2 349 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 PRR19A6NJB7 356 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 OR2T7P0C7T2 308 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 DAOP14920 347 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 SLC6A6P31641 620 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 CCKBRP32239 447 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 PBX2P40425 430 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 ELFN2Q5R3F8 820 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 NAA40Q86UY6 237 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 OR2T27Q8NH04 317 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 OR5AK2Q8NH90 309 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 MIOXQ9UGB7 285 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 POM121BA6NF01 834 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 RFPL4AA6NLU0 287 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 IL5P05113 134 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 ADRA2CP18825 462 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 DRD3P35462 400 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 PEA15Q15121 130 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 IRF4Q15306 451 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 C9orf152Q5JTZ5 239 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 LIPNQ5VXI9 398 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 LEG1Q6P5S2 330 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 USP53Q70EK8 1073 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 NT5CQ8TCD5 201 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 ISOC2Q96AB3 205 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 SLC6A7Q99884 636 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 SELENOIQ9C0D9 397 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 PRR13Q9NZ81 148 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 GXYLT2A0PJZ3 443 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 ALOX12BO75342 701 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 AKAIN1P0CW23 69 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 POU3F4P49335 361 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 ZAR1Q86SH2 424 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 OR6N2Q8NGY6 317 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 TCEAL3Q969E4 200 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP11-201ENST00000239367 DUSP22Q9NRW4 184 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms