RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	MLX	Q9UH92	298 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	MPIG6B	O95866	241 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	RBP7	Q96R05	134 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	CD207	Q9UJ71	328 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	HTT	P42858	3142 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	SCN4A	P35499	1836 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	HTR3B	O95264	441 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	UTS2	O95399	124 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	CD3D	P04234	171 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	PGC	P20142	388 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	RABIF	P47224	123 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A0B4J2E0	115 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A1B0GX12	115 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	AKAIN1	P0CW23	69 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	BMF	Q96LC9	184 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	CA14	Q9ULX7	337 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	DISC1	C4P0D8	188 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	IGHA1	P01876	353 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	RLN2	P04090	185 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	PNMT	P11086	282 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	TSSK4	Q6SA08	328 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	STAC	Q99469	402 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A0C4DFX4	3053 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM235	A6NFC5	223 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	GABARAP	H6UMI1	98 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	PRAF2	O60831	178 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	KNG1	P01042	644 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	TLE3	Q04726	772 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	GSG1	Q2KHT4	349 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	FCRL6	Q6DN72	434 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	OR6V1	Q8N148	313 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	MED30	Q96HR3	178 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF726	A6NNF4	738 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	AIP	O00170	330 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	P2RY10	O00398	339 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	HCRTR1	O43613	425 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	RAP2B	P61225	183 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	ELOC	Q15369	112 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SPIN3-223	ENST00000639525	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		10.73	□□□□□ -0.69

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