RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	C8orf44	Q96CB5	159 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	OR2M2	Q96R28	347 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	FOXQ1	Q9C009	403 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A1B0GW55	424 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	IFITM5	A6NNB3	132 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	P2RY10	O00398	339 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	SUSD5	O60279	629 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	GLCE	O94923	617 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	F10	P00742	488 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	PTGS2	P35354	604 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	S100A10	P60903	97 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	CAMK2D	Q13557	499 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	RBP7	Q96R05	134 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	DUX4	Q9UBX2	424 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	SCML1	Q9UN30	329 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF726	A6NNF4	738 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	RP2	O75695	350 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	MPIG6B	O95866	241 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	PNMT	P11086	282 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	ERG	P11308	486 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	FCAR	P24071	287 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	OR3A2	P47893	321 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	COX15	Q7KZN9	410 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	SPERT	Q8NA61	448 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	ADAM11	O75078	769 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	HTR3B	O95264	441 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	MPZL1	O95297	269 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	SCGB1D2	O95969	90 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	LINC00303	Q3SY05	128 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	LPAR4	Q99677	370 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A1B0GV50	99 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF878	C9JN71	531 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	CXADR	P78310	365 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	BTN1A1	Q13410	526 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	CBFB	Q13951	182 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	OPCML	Q14982	345 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	BATF2	Q8N1L9	274 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	GBF1	Q92538	1859 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	C3orf49	Q96BT1	292 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	OR5B2	Q96R09	309 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	OR1F2P	Q96R84	312 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	LRRC61	Q9BV99	259 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	FREM3	P0C091	2139 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449		F5H5K5	113 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	CCNO	P22674	350 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	CCR9	P51686	369 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	11.61	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	YPEL5	P62699	121 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	SERTAD2	Q14140	314 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	RAB30	Q15771	203 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ACSS3-208	ENST00000616449	ACKR1	Q16570	336 aa		11.61	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms