RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598594.1

PAF1-208, Transcript of PAF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component, human

TSL 2

Gene PAF1, Length 280 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAF1-208	ENST00000598594	RNF212B	A8MTL3	300 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	C21orf140	B9A014	251 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594		E9PAM4	449 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594		F5H5T6	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594		J3QLI3	93 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	EI24	O14681	340 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TOM1	O60784	492 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	IGHG4	P01861	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	GP1BB	P13224	206 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	CRABP1	P29762	137 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	FOXN2	P32314	431 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RFC3	P40938	356 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	XCR1	P46094	333 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	AVPR1B	P47901	424 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	CLDN12	P56749	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM33	P57088	247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PRKCD	Q05655	676 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SPA17	Q15506	151 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	HAGH	Q16775	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	DUSP7	Q16829	419 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594		Q6ZSR9	355 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	MDS2	Q8NDY4	140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	OR51F2	Q8NH61	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	STMN2	Q93045	179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TLCD1	Q96CP7	247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RNF2	Q99496	336 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	NUDT9	Q9BW91	350 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TPK1	Q9H3S4	243 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	C6orf50	Q9HD87	102 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	DHRS7	Q9Y394	339 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	OARD1	Q9Y530	152 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	KIAA0232	Q92628	1395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ASPDH	A6ND91	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	EFCAB7	A8K855	629 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SLC1A7	O00341	560 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ACOT8	O14734	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TIMM23	O14925	209 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	MPPED1	O15442	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	FGF16	O43320	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	FADS1	O60427	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	MPZL2	O60487	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PEX10	O60683	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SMIM24	O75264	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TRAPPC6A	O75865	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TDP2	O95551	362 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RAB36	O95755	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ATP1B1	P05026	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SERPINB2	P05120	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	CCDC166	P0CW27	439 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	FUT3	P21217	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	TIMP3	P35625	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	VHL	P40337	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	BTG1	P62324	171 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	DGCR2	P98153	550 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	ITPK1	Q13572	414 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAF1-208	ENST00000598594	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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