RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 FAM166AQ6J272 317 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF540Q8NDQ6 660 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM54Q969K7 222 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-209ENST00000567771 VIPAS39Q9H9C1 493 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-209ENST00000567771 CHODLQ9H9P2 273 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-209ENST00000567771 KCNS2Q9ULS6 477 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-209ENST00000567771 CMAHPQ9Y471 501 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-209ENST00000567771 SVEP1Q4LDE5 3571 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-209ENST00000567771 MXRA5Q9NR99 2828 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 ADRA2AP08913 450 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF23P17027 643 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 GIPRP48546 466 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 MELKQ14680 651 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 METTL21CQ5VZV1 264 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 PHC2Q8IXK0 858 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 OR6X1Q8NH79 312 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 SIKE1Q9BRV8 207 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 PCDHAC1Q9H158 963 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 NANSQ9NR45 359 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 GLTPQ9NZD2 209 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 RNF13O43567 381 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 RAB36O95755 333 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 PATE4P0C8F1 98 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 NANOGP8Q6NSW7 305 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 CCDC80Q76M96 950 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 SKA3Q8IX90 412 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 FGFBP3Q8TAT2 258 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 MPP4Q96JB8 637 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 PRSS27Q9BQR3 290 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 SOX7Q9BT81 388 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF426Q9BUY5 554 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 NANOGQ9H9S0 305 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 LRP5LA4QPB2 252 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 UBL3O95164 117 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 GIFP27352 417 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 RAB39AQ14964 217 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 RABL3Q5HYI8 236 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 LRFN4Q6PJG9 635 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 IL17RELQ6ZVW7 336 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 SLC19A3Q9BZV2 496 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 TPK1Q9H3S4 243 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF229Q9UJW7 825 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 SPEF1Q9Y4P9 236 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 ASAH2BP0C7U1 165 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 UMPSP11172 480 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 GLRXP35754 106 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF786Q8N393 782 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 UBASH3BQ8TF42 649 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 RASSF5Q8WWW0 418 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM158Q8WZ71 300 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF566Q969W8 418 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 LYNX1G3V0Z9 82 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 TGFAP01135 160 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 HIST1H2ABP04908 130 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 LYNX1P0DP58 116 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 EVX1P49640 407 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 FAM120AOSQ5T036 256 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 CALHM3Q86XJ0 350 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF584Q8IVC4 421 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 SLC22A24Q8N4F4 322 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 HIST1H2ACQ93077 130 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 SYT3Q9BQG1 590 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 SH3GLB1Q9Y371 365 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 FXYD1O00168 92 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 DHHO43323 396 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 SYNGR3O43761 229 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 LILRA1O75019 489 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 SASH3O75995 380 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 TACSTD2P09758 323 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 PGA4P0DJD7 388 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 PGA3P0DJD8 388 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 TNFRSF1BP20333 461 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 IL2RGP31785 369 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 FXNQ16595 210 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 LRP11Q86VZ4 500 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 CARM1Q86X55 608 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 NKAIN4Q8IVV8 208 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 LRRC58Q96CX6 371 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 SH3GL3Q99963 347 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM38BQ9NVV0 291 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 REV1Q9UBZ9 1251 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-209ENST00000567771 FBXL3Q9UKT7 428 aa21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms