RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511978.5

MATR3-218, Transcript of matrin 3, human

TSL 3

Gene MATR3, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-218	ENST00000511978	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	GPX3	P22352	226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	NTS	P30990	170 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	SOX3	P41225	446 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	SLC1A6	P48664	564 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	SLC18A1	P54219	525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	BST1	Q10588	318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	FUT7	Q11130	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	KIAA0040	Q15053	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	LTB4R	Q15722	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	SPINK14	Q6IE38	97 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978		Q6ZSR9	355 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	FCRL1	Q96LA6	429 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	ZNF681	Q96N22	645 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	TSSK3	Q96PN8	268 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	RASL10B	Q96S79	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	SORT1	Q99523	831 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	LAT2	Q9GZY6	243 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	CLMP	Q9H6B4	373 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	HPF1	Q9NWY4	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978		A0A0G2JMM0	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978		A0A1W2PPB8	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978		A0A1W2PRS3	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	PEX11A	O75192	247 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	ATP6AP2	O75787	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	LRAT	O95237	230 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	ZNF24	P17028	368 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	MPZ	P25189	248 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	RFC3	P40938	356 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	CAPZA2	P47755	286 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	TDGF1P3	P51864	188 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67	1e-8	■■□□□ 13.6
MATR3-218	ENST00000511978	C2orf80	Q0P641	193 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	STX3	Q13277	289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	PDE7A	Q13946	482 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	CEBPE	Q15744	281 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	NNAT	Q16517	81 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	TTMP	Q5BVD1	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	OPN5	Q6U736	354 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	TMEM107	Q6UX40	140 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	RTL4	Q6ZR62	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	LIX1	Q8N485	282 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MATR3-218	ENST00000511978	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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