RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1B0GTH9 108 aa14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C11orf98E9PRG8 122 aa14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC43A1O75387 559 aa14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TOXO94900 526 aa14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDAH2O95865 285 aa14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPR2P20594 1047 aa14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC6A1P30531 599 aa14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCL7P80098 99 aa14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRK1Q15835 563 aa14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCTE1Q5JU00 501 aa14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINGO2Q7L985 606 aa14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q96M85 177 aa14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FKRPQ9H9S5 495 aa14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOX4Q9NPH5 578 aa14.09□□□□□ -0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TVP23AA6NH52 213 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLB1P16278 677 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NRG3P56975 720 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SIRPAP78324 504 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BDH1Q02338 343 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LEG1Q6P5S2 330 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLXDC1Q8IUK5 500 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HYLS1Q96M11 299 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM2Q9C040 744 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CXCL3P19876 107 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF81P51508 661 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB14P61106 215 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LYSMD4Q5XG99 296 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ULK3Q6PHR2 472 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPAT4Q86UL3 456 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C14orf105Q9NVL8 296 aa14.08□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC00587B1AMM8 73 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPIPB9F8W1W9 429 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD34CP0C6C1 535 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SKP1P63208 163 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HLA-BQ31612 363 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PHF19Q5T6S3 580 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF721Q8TF20 911 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALOX12BO75342 701 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DHFRP00374 187 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR8G3PP0DMU2 310 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPXP11678 715 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BTCP35070 178 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDK5R1Q15078 307 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSD17B12Q53GQ0 312 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCEAL6Q6IPX3 200 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAAF1Q8NEP3 725 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELOA3Q8NG57 546 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNASE2BQ8WZ79 361 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCEAL3Q969E4 200 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC6A5Q9Y345 797 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRSS44E7EML9 344 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCDO00767 359 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAD1O60671 282 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CENPAP49450 140 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAS2R43P59537 309 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLA1AQ53H76 456 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HPF1Q9NWY4 346 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCDNQ9UBB6 729 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHRNA9Q9UGM1 479 aa14.07□□□□□ -0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM72A0PK05 275 aa14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms