RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PFN3P60673 137 aa15.84■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAMK2BQ13554 666 aa15.84■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa15.84■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C20orf24Q9BUV8 137 aa15.84■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRSS16Q9NQE7 514 aa15.84■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TUSC2O75896 110 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NXPH3O95157 252 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PIPP12273 146 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BCKDHBP21953 392 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IKZF1Q13422 519 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 XKR7Q5GH72 579 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD300LGQ6UXG3 332 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF511Q8NB15 262 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TCTN2Q96GX1 697 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPR78Q96P69 363 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR13C7P0DN81 318 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C9orf135Q5VTT2 229 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RTL10Q7L3V2 364 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FGGYQ96C11 551 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WWTR1Q9GZV5 400 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF576Q9H609 170 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ASIC5Q9NY37 505 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPT2Q9UMR5 302 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SRPK3Q9UPE1 567 aa15.83■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR1D4P47884 311 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPY4RP50391 375 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HBG1P69891 147 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HBG2P69892 147 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DMBX1Q8NFW5 382 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PFN4Q8NHR9 129 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLCO4A1Q96BD0 722 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RASD2Q96D21 266 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBXO8Q9NRD0 319 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C2orf72A6NCS6 295 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MCRIP1C9JLW8 97 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TXNDC12O95881 172 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DRD1P21728 446 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TGFBR1P36897 503 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC16A14Q7RTX9 510 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EID2Q8N6I1 236 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBQLN3Q9H347 655 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LINC01553A4QN01 128 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLN5O75503 358 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MEP1BQ16820 701 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYT14P1Q58G82 188 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SSX9Q7RTT3 188 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PHYHIPQ92561 330 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PIGMQ9H3S5 423 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAB22AQ9UL26 194 aa15.83■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYO10Q9HD67 2058 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADAM10O14672 748 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PMPCAQ10713 525 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GSX2Q9BZM3 304 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A0A6YYJ9 748 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPX5O75715 221 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM71E1Q6IPT2 247 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 H3F3CQ6NXT2 135 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LINC01465Q8N7H1 131 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C2CD4CQ8TF44 421 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAF9BQ9HBM6 251 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPP1R2P9O14990 202 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DDAH2O95865 285 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LPLP06858 475 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GIPP09681 153 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DPP4P27487 766 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TEAD1P28347 426 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTGER4P35408 488 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SRPXP78539 464 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MZT1Q08AG7 82 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CATR1Q13166 79 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF266Q14584 549 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LTC4SQ16873 150 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LANCL3Q6ZV70 420 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAAR2Q9P1P5 351 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSFX1Q9UBD0 423 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZFAND5O76080 213 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MGST1P10620 155 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TESK1Q15569 626 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR10Z1Q8NGY1 313 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAB39BQ96DA2 213 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF170Q96K19 258 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM43Q9BTV4 400 aa15.82■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM129A0AVI4 362 aa15.81■□□□□ 0.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SULT1C4O75897 302 aa15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms