RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PFN4Q8NHR9 129 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FNDC8Q8TC99 324 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM54Q969K7 222 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FBXW5Q969U6 566 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF566Q969W8 418 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TXNDC15Q96J42 360 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NSMCE2Q96MF7 247 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GSX2Q9BZM3 304 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CRLF2Q9HC73 371 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 INIPQ9NRY2 104 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAIMQ9NVQ4 179 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MED29Q9NX70 200 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NDUFAF4Q9P032 175 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ACTR3BQ9P1U1 418 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM5Q9Y2B1 443 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 POFUT2Q9Y2G5 429 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TACC2O95359 2948 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EFCAB9A8MZ26 197 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 J3KTA2 159 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 M0R1B8 84 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 M0R3G1 203 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ABCD4O14678 606 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARPC2O15144 300 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SMPD2O60906 423 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLAUP00749 431 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGHG1P01857 330 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 T-ENOLP0DO92 83 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CBR1P16152 277 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ACADSP16219 412 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARR3P36575 388 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AQP2P41181 271 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 YAP1P46937 504 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF83P51522 516 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BIDP55957 195 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARF1P84077 181 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LGALS3BPQ08380 585 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CAMK2DQ13557 499 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HIST3H3Q16695 136 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HIKESHIQ53FT3 197 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ALG10Q5BKT4 473 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF730Q6ZMV8 503 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NRMQ8IXM6 262 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC7A13Q8TCU3 470 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF347Q96SE7 839 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SEPHS2Q99611 448 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCL19Q99731 98 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EMC6Q9BV81 110 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ULBP2Q9BZM5 246 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CXorf56Q9H5V9 222 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IL1RAPQ9NPH3 570 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TAS2R1Q9NYW7 299 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GLTPQ9NZD2 209 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NPAP1Q9NZP6 1156 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FBXL3Q9UKT7 428 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ROS1P08922 2347 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 A6NIZ1 184 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 VSTM5A8MXK1 200 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SHISA9B4DS77 424 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MCIDASD6RGH6 385 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CLOCKO15516 846 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DHHO43323 396 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AHCYL1O43865 530 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRT36O76013 467 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 STAMBPO95630 424 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGKV3-15P01624 115 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGLV1-44P01699 117 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CRYAAP02489 173 aa7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms