RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 INIPQ9NRY2 104 aa14.13□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CA10Q9NS85 328 aa14.13□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.13□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NDUFS7O75251 213 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UBL3O95164 117 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGLV1-44P01699 117 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HLA-HP01893 362 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 F13BP05160 661 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NR2C1P13056 603 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DRD4P21917 467 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SERPINF1P36955 418 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AQP2P41181 271 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF84P51523 738 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PIGFQ07326 219 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CBLL1Q75N03 491 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OFCC1Q8IZS5 231 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM54Q969K7 222 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BPIFA2Q96DR5 249 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HSH2DQ96JZ2 352 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C20orf141Q9NUB4 165 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RHCGQ9UBD6 479 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPEF1Q9Y4P9 236 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FKBP7Q9Y680 259 aa14.12□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RNF223E7ERA6 249 aa14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 H7C417 338 aa14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DCTN3O75935 186 aa14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PDE5AO76074 875 aa14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LY6G6DO95868 133 aa14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR8G3PP0DMU2 310 aa14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NCK1P16333 377 aa14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GYS2P54840 703 aa14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DSCR9P59020 149 aa14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MXRA7P84157 204 aa14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF730Q6ZMV8 503 aa14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ABCD2Q9UBJ2 740 aa14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.11□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CADP27708 2225 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USF3Q68DE3 2245 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 B9A039 149 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DHHO43323 396 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PIP5K1CO60331 668 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CELA3BP08861 270 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 QDPRP09417 244 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR4A8P0C604 315 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PGA4P0DJD7 388 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PGA3P0DJD8 388 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAB1AP62820 205 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPP2R2BQ00005 443 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GALK2Q01415 458 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ALG10Q5BKT4 473 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GLYATQ6IB77 296 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NHLRC1Q6VVB1 395 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF627Q7L945 461 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NOXO1Q8NFA2 376 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUP37Q8NFH4 326 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HTRA1Q92743 480 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 REG4Q9BYZ8 158 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNN2Q9H2S1 579 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RNF121Q9H920 327 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SEC61A2Q9H9S3 476 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NDE1Q9NXR1 346 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EGFL7Q9UHF1 273 aa14.1□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EFCAB9A8MZ26 197 aa14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CENPBD1B2RD01 187 aa14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 J3KTA2 159 aa14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CSF3P09919 207 aa14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ACADSP16219 412 aa14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NPR2P20594 1047 aa14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CALCRP30988 508 aa14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GIPRP48546 466 aa14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EFNA4P52798 201 aa14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CD47Q08722 323 aa14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DAG1Q14118 895 aa14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRT72Q14CN4 511 aa14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TAF11Q15544 211 aa14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC36A2Q495M3 483 aa14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DPPA2Q7Z7J5 298 aa14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OAFQ86UD1 273 aa14.09□□□□□ -0.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NRMQ8IXM6 262 aa14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms